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明天琳琳新蟲 (初入文壇)
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[求助]
納米壓痕相關(guān)的lammps程序（新手上路） 已有2人參與
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我剛剛學(xué)lammps沒多久，自己剛剛弄好了一個(gè)程序，怎么改都錯(cuò)了好多，特請(qǐng)教大神幫忙提點(diǎn)錯(cuò)誤…… units metal dimension 3 boundary p p m atom_style atomic neighbor 2.0 bin neigh_modify delay 3 lattice fcc 3.615 #define groups region box1 block 0 20 0 20 0 10 units box region box2 block 0 20 0 20 10 20 units box region box3 block 0 20 0 20 25 31 units box create_box 1 box1 create_box 1 box2 create_box 1 box3 create_atoms 1 region box1 create_atoms 1 region box2 create_atoms 1 region box3 group 11 region box1 group 22 region box2 group 33 region box3 #Potential Setting pair_style eam pair_coeff * * Cu_u3.eam Cu mass 1 63.55 #indention fix 1 11 setforce 0.0 0.0 0.0 variable z equal vdisplace(28,-0.1) fix 2 33 indent 100 sphere 10 10 v_z 3.0 compute cna all cna/atom 4.363 compute str all stress/atom fix 3 all nvt temp 0 0 0.1 variable Temp equal temp variable EnerPot equal 20 thermo ${ThermoDump} thermo_style custom step temp pe dump 5 all cfg 100 dump.*.cfg mass type xs ys zs id c_cna c_str[2] fix 6 all print 500 "${Step} ${Temp} ${EnerPot} ${pe}" file Cu.dat title "Temp pe" screen no minimize 1e-10 1e-12 2000 2000 timestep 0.001 run 1000000  |
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明天琳琳
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2樓2017-01-08 21:07:06
MD小師弟
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【答案】應(yīng)助回帖
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create_box命令用多了，應(yīng)該是只有一個(gè)box nvt系綜的溫度設(shè)置為0.01 在box1到3 的region里建立原子，如果分別在三個(gè)區(qū)域中建立原子，可能會(huì)產(chǎn)生原子距離過近的問題，所以可以用 region union的命令把三個(gè)region整合為一個(gè)再建立原子（region之間有交集關(guān)系并無影響） 暫時(shí)就想到這么多，不一定完全正確，僅做參考 fix indent這玩意我也不太懂，如果有什么進(jìn)展，還請(qǐng)不吝賜教！ |
3樓2017-01-13 12:28:59
明天琳琳
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4樓2018-03-28 09:19:40
5樓2020-06-13 21:04:09
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