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h_qiang新蟲(chóng) (初入文壇)
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[交流]
求教測(cè)序reads拼接不全的文件，怎么做進(jìn)化樹(shù)呢？ 已有2人參與
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比如10 株細(xì)菌的全基因組重測(cè)序reads拼接完成后，得到如下格式文件： >NODE_1 ATCATCATCTAC >NODE_2 CCTAATATCCCTATA 這樣的十個(gè)文件，每個(gè)菌株的序列都不是測(cè)通的，每個(gè)菌株的序列都擁有一個(gè)獨(dú)立的文件。 請(qǐng)問(wèn)各位前輩，我如果做進(jìn)化樹(shù)的話(huà)，應(yīng)該怎么處理這些文件呢，是需要用什么方法將它連貫起來(lái)，還是這種不測(cè)通的就能直接做。希望詳細(xì)一些~萬(wàn)分感謝！ |
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baichi121234
禁蟲(chóng) (職業(yè)作家)
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本帖內(nèi)容被屏蔽 |
2樓2017-01-12 15:14:03
★
小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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如果公司沒(méi)有拼接的話(huà)，就需要自己去拼接這些序列，檢查是否測(cè)通了。如果沒(méi)有，再和公司溝通看是補(bǔ)測(cè)還是怎么辦？ 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
3樓2017-01-12 23:42:57
h_qiang
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 8
- 帖子: 2
- 在線(xiàn): 20分鐘
- 蟲(chóng)號(hào): 4368004
- 注冊(cè): 2016-01-19
- 專(zhuān)業(yè): 生物信息學(xué)
4樓2017-01-16 10:11:30
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