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幻月zero新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
如何比對(duì)中兩個(gè)蛋白質(zhì)的保守結(jié)構(gòu)域的匹配程度 已有1人參與
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| 在NCBI上找到兩個(gè)蛋白質(zhì),想看看他們?cè)诒J亟Y(jié)構(gòu)域的匹配程度有多少,請(qǐng)問(wèn)各位大神這個(gè)怎么弄?或者需要什么軟件?求詳解 |
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
| 你是想看一級(jí)序列的匹配程度還是想看三級(jí)結(jié)構(gòu)的匹配程度?序列比對(duì)很多軟件和網(wǎng)站都可以做,像vector NTI等等。三級(jí)結(jié)構(gòu)比,對(duì)貌似pfam數(shù)據(jù)庫(kù)有這個(gè)功能;蛘咧苯訉⑷(jí)結(jié)構(gòu)的PDB文件導(dǎo)入pymol進(jìn)行比對(duì)。 |

新蟲(chóng) (初入文壇)
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2樓: Originally posted by keke226 at 2017-02-21 23:22:55 你是想看一級(jí)序列的匹配程度還是想看三級(jí)結(jié)構(gòu)的匹配程度?序列比對(duì)很多軟件和網(wǎng)站都可以做,像vector NTI等等。三級(jí)結(jié)構(gòu)比,對(duì)貌似pfam數(shù)據(jù)庫(kù)有這個(gè)功能;蛘咧苯訉⑷(jí)結(jié)構(gòu)的PDB文件導(dǎo)入pymol進(jìn)行比對(duì)。 您好呀,請(qǐng)教一下如何PYMOL進(jìn)行兩個(gè)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)比對(duì),我在網(wǎng)上看了很多教程都是講通過(guò)PYMOL對(duì)蛋白質(zhì)顏色啊什么的進(jìn)行修飾。如果您知道如何比對(duì)能告訴我嗎?非常感謝 |
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