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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » 綜合其他 » 有關cuffdiff的提問
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[求助]
有關cuffdiff的提問
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大家好，我現(xiàn)在有一個問題，在做cuffdiff之前一般都會先做cufflinks和cuffmerge來生成樣品的轉錄本注釋文件，這個注釋文件會在cuffdiff中被使用到，那么我可否不使用這個注釋文件，直接用之前tophat使用的全基因組注釋文件來運行cuffdiff呢，還有就是cuffdiff在運行時會對reads進行組裝拼接嗎 如題！上網(wǎng)上查說的都不一樣啊！這兩者應該怎么換算啊 [ Last edited by 一條求知的蟲 on 2017-9-4 at 11:25 ] |
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