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想求助楊樹蛋白質(zhì)組學(xué)iTRAQ數(shù)據(jù)差異倍數(shù)的選擇
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我在外面公司做的楊樹葉片iTRAQ標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)，現(xiàn)在給我的初始數(shù)據(jù)讓我挑選差異倍數(shù)。 一共鑒定出7166個蛋白質(zhì)，公司的人和我說要卡蛋白組通量在5%-15%，也就是說差異蛋白數(shù)量要在350-1000大概范圍內(nèi)，這樣的話只有1.2和1.3差異倍數(shù)符合要求，要我從這兩個中間進(jìn)行選擇，可是我看的相關(guān)文獻(xiàn)都是差異倍數(shù)是1.5，但是1.5的差異蛋白量沒有那么多，我跟他說文獻(xiàn)都是1.5倍的，他說iTRAQ比2-DE靈敏不需要跟文獻(xiàn)一樣是1.5倍。這樣真的可以嗎？他如果這么確定差異倍數(shù)，會不會影響我的論文以及畢業(yè)啊？ |
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