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xuduo918鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何從概率密度分布，通過玻爾茲曼關(guān)系轉(zhuǎn)換成自由能呢
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大家好！ 我用amber力場跑一種蛋白質(zhì)的md，現(xiàn)在已經(jīng)有軌跡文件了，我想計算其中一個二面角扭轉(zhuǎn)的自由能變化，得到的結(jié)果圖橫坐標是二面角的角度，縱坐標是自由能的變化，表現(xiàn)出自由能隨二面角角度的變化的變化。因為是新手，還不是很懂，請問大家這個要怎么計算呢，有沒有比較詳細一些的教程呢。我之前請教了別人，他告訴我可以計算二面角的概率密度分布，然后通過玻爾茲曼關(guān)系轉(zhuǎn)換成自由能，但是我還是不清楚要怎么計算，如果有清楚的高手能麻煩更詳細的解釋一下嗎? 謝謝大家！ |
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2樓2020-05-23 23:03:17
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