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簡(jiǎn)點(diǎn)愛(ài)新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
vmd前期所需的pdb文件怎么得到 已有1人參與
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本人現(xiàn)在對(duì)namd、vmd初次接觸，要做金屬材料方面的分子動(dòng)力學(xué)模擬，可是不知道一開(kāi)始的pdb文件怎么獲得？哪位有經(jīng)驗(yàn)的，希望能給我指導(dǎo)指導(dǎo) 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
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hclwonder
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- 專(zhuān)業(yè): 藥物設(shè)計(jì)與藥物信息
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至于pdb文件，做生物分子的一般是從pdb數(shù)據(jù)庫(kù)下載或者自己模建，但材料方面的不了解，我倒是用用薛定諤軟件搭建過(guò)碳納米的結(jié)構(gòu)，不過(guò)只是試試玩玩，并不懂的。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
4樓2017-03-15 20:08:56
myfantasy8
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在pdb數(shù)據(jù)庫(kù)里下載，百度pdb，蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站！ 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
2樓2017-03-15 19:08:09
hclwonder
新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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namd主要用在生物分子方面，如果專(zhuān)業(yè)做材料恐怕不合適，lammps是更適合材料科學(xué)的，樓主或許可以看看。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
3樓2017-03-15 20:00:48
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5樓2017-03-22 11:39:03
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