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caffey0387木蟲 (正式寫手)
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[交流]
DSLibscore問題請(qǐng)教 已有2人參與
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請(qǐng)問下大家,一般用Libdock進(jìn)行小分子和蛋白的對(duì)接,打分函數(shù)能給出的分?jǐn)?shù)大概有多少?我做了個(gè)對(duì)接,打分達(dá)到122分,這個(gè)是不是說明對(duì)接結(jié)果比較好? 另外,我的電腦做小點(diǎn)的蛋白還可以,做某些大的蛋白就死機(jī),有時(shí)候會(huì)直接關(guān)閉程序,有時(shí)候會(huì)彈出對(duì)話框:bad allocation之類的,這個(gè)是我的機(jī)器太慢的原因嗎?我是先用SYBYL先去水分子去配體,然后生成的某某_H文件在DS2.5里打開的,然后按照教程一步步做的。請(qǐng)各位老師指教。。! |
木蟲 (正式寫手)
木蟲 (正式寫手)
新蟲 (初入文壇)
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同學(xué),我是西南大學(xué)的學(xué)生,最近也在研究libdock,想請(qǐng)教下你是怎么準(zhǔn)備小分子配體的,謝謝? 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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