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jama69696新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
如何設(shè)計(jì)熒光定量pcr引物？ 已有2人參與
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如題，分子小白，求助，我現(xiàn)在只會(huì)用DNAMAN設(shè)計(jì)8普通的引物，但是熒光定量pcr的產(chǎn)物應(yīng)該是小于300bp，那我應(yīng)該從哪段開(kāi)始設(shè)計(jì)引物呢？？如何查找基因的內(nèi)含子和外顯子？？？ 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
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我的經(jīng)驗(yàn)real-time引物最好不要超過(guò)200吧。至于在哪一段設(shè)計(jì)就看你自己實(shí)驗(yàn)的目的了 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
2樓2017-04-11 16:08:34
jama69696
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3樓2017-04-11 19:47:47
4樓2017-04-11 19:56:45
jama69696
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5樓2017-04-11 20:08:47
2298827423
銀蟲(chóng) (初入文壇)
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6樓2017-04-12 14:02:51
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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一般思路：NCBI搜索基因核苷酸序列，序列里面選擇CDS，復(fù)制，然后打開(kāi)premer5 粘貼 ，然后想怎么設(shè)計(jì)就怎么設(shè)計(jì)了！當(dāng)然，很多基因會(huì)有很多轉(zhuǎn)錄本，這就要選擇幾條轉(zhuǎn)錄本比對(duì)，然后在根據(jù)比對(duì)結(jié)果設(shè)計(jì)引物。 其實(shí)最簡(jiǎn)單的方法，交給引物合成公司，只要提供基因名稱和genbank序列號(hào) 物種，引物公司就設(shè)計(jì)合成，引物設(shè)計(jì)不收費(fèi)！我是試劑公司的，也可以合成引物，可以加我QQ：122395323詳聊！ |
7樓2017-04-13 14:56:49
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