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初衷。新蟲 (初入文壇)
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[求助]
解離能怎么做 已有2人參與
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我在做一個(gè)HgX2(x是鹵素)的解離能 不太清楚具體怎么用高斯來計(jì)算 已經(jīng)做了分子的opt+freq 接下來是不是分成片段Hg+X2來opt+freq然后再算前后的能差呢 求各位前輩大神教教我 都困擾了好幾天 網(wǎng)上也沒看到別人具體怎么做的 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
版主 (著名寫手)
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conventional解離能可以直接opt算出complex的能量 和每一個(gè)monomer的能量 然后用樓上樓上給的公式BDE=E(complex)-E(monomer1)-E(monomer2)。 也可以考慮BSSE并且用counterpoise方法進(jìn)行校正。 關(guān)鍵詞就是counterpoise input寫法大概就是 # B3LYP/SDD Counterpoise=2 NoSymm Opt HgX + X, optimization with counterpoise correction using ECP basis 0 1 0 2 0 2 ! charge and multiplicity for complex, monomer1, and monomer 2, respectively Hg(Fragment=1) 0.00000000 0.00000000 2.000 X(Fragment=1) 0.00000000 0.00000000 1.000 X(Fragment=2) 0.00000000 0.00000000 3.000 正常算完的話找到輸出文件里面類似這樣的話 Counterpoise corrected energy = xxxxx BSSE energy = xxxxx sum of fragments = xxxxxx complexation energy = xxxxx kcal/mole (raw) complexation energy = xxxxx kcal/mole (corrected) 基本上就能得到解離能了 |
專家顧問 (著名寫手)
新蟲 (初入文壇)
新蟲 (初入文壇)
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太感謝了 這個(gè)真的特詳細(xì) 我還在sob的帖子里看到另一種感覺是不同的方法 先算整個(gè)分子HgX2的能量 然后減去Hg原子個(gè)X2分子的單點(diǎn)能 完了后兩者想加減分子能量再加上熱化學(xué)修正的量 這樣算是不是也可以 那兩種方法哪種的更可靠呢 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
版主 (著名寫手)
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零點(diǎn)校正 是應(yīng)該加進(jìn)去的 既然分解前后振動(dòng)差距很大。做法就是 分別opt freq complex和兩個(gè)monomer 得到零點(diǎn)校正以后的能量(zero-point corrected energy) 然后再用公式BDE=E(complex_corr)-E(mono1_corr)-E(mono2_corr)就可以了.這個(gè)和BSSE校正是不同類型的校正 BSSE校正主要是修正計(jì)算中人為加入的誤差 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
新蟲 (初入文壇)
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