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[求助]
求助，關(guān)于read count和FPKM的問題
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我的流程基本參照nature protocol的hisat2+stringtie+ballgown 問題出現(xiàn)在stringtie最后給ballgown輸出的文件中，e_data中顯示某個exon有很多的read counts，但是在t_data中相應(yīng)的transcripts的FPKM卻為0 我檢查過annotation和stringtie拼接的完整轉(zhuǎn)錄本，這個exon以及transcript的起始終止位點并沒有不一致，所以我完全想不通，求指點，謝謝！ |
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