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微笑愛(ài)上我新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
NAMD動(dòng)力學(xué) 已有1人參與
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| 小伙伴們，有人知道為什么在跑由蛋白質(zhì)和石墨烯構(gòu)成的體系的NAMD動(dòng)力學(xué)時(shí)，石墨烯會(huì)變形？謝謝啦 |
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微笑愛(ài)上我
新蟲(chóng) (初入文壇)
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6樓2017-06-05 16:53:10
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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你在nand里面給石墨烯設(shè)置位置限制啊。 再說(shuō)，石墨烯在動(dòng)力學(xué)平衡過(guò)程中本來(lái)就會(huì)變形啊，他們又不是剛體 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
2樓2017-05-18 00:26:36
xiaoniupahu
新蟲(chóng) (初入文壇)
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有沒(méi)有用gridforce，如果用了gridforce的話，那就是去掉石墨烯上的標(biāo)記，只標(biāo)記DNA就好了 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
3樓2017-05-24 19:51:25
xiaoniupahu
新蟲(chóng) (初入文壇)
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對(duì)pdb文件中的beta值和occupancy值進(jìn)行修改就可以了，可以寫(xiě)個(gè)腳本 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
4樓2017-05-24 19:53:13
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