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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » MS » MS軟件怎么模擬兩個高分子之間的氫鍵？
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| 查看: 1165 | 回復: 4 | |||
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[求助]
MS軟件怎么模擬兩個高分子之間的氫鍵？ 已有1人參與
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| 我是用AC模塊構(gòu)建無定型細胞，然后使用forcite模塊進行結(jié)構(gòu)優(yōu)化和動力學，最后算出體系的總能量，然后扣除其中的一個分子，計算剩余體系的能量，用體系的總能量-兩個分子單獨的能量，是否是兩分子間的氫鍵？算出來能量差數(shù)值是-123左右，說明是氫鍵嗎？另一個結(jié)構(gòu)的算出來是正的一百多？不知道怎么分析，求教大神相助，不勝感激�。。。� |
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【答案】應助回帖
感謝參與，應助指數(shù) +1
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我個人覺得這個取決于力場，如果力場中分子間相互作用力和分子內(nèi)相互作用力僅差氫鍵作用，那么你這么做就是可行的，否則就不能這樣算。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2017-05-23 17:43:24
趙紅霞
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計算化學
2樓2017-05-23 15:48:39
yuzhiboban
新蟲 (初入文壇)
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- 專業(yè): 化學反應工程
4樓2017-09-28 12:30:33
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