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陌路行客金蟲 (小有名氣)
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[求助]
關(guān)于點(diǎn)突變引物設(shè)計(jì)
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最近在學(xué)習(xí)點(diǎn)突變引物設(shè)計(jì),有時(shí)候遇到這種情況,就是根據(jù)文獻(xiàn)只知道某個(gè)基因的氨基酸變異位點(diǎn),那么如何根據(jù)這個(gè)氨基酸的變異位點(diǎn)查詢到對(duì)應(yīng)的mRNA位點(diǎn)和基因組DNA位點(diǎn)? 比如,EGFR的一個(gè)常見突變L858R,文獻(xiàn)資料有提到是c.2573的T突變?yōu)镚,這個(gè)c是cDNA嗎?是不是和NCBI里面對(duì)應(yīng)的mRNA位點(diǎn)一致?(我試著對(duì)比了一下,好像對(duì)不上,EGFR有幾個(gè)mRNA剪接體,可能我沒有找對(duì));又該如何查到這個(gè)L858R的在基因組中的突變位點(diǎn)呢,因?yàn)樵O(shè)計(jì)引物就是檢測基因組中是否存在L858R的突變,但是不知道怎么找到這一段基因組DNA序列,請(qǐng)各位大神多多指教。 |

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