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zmrc新蟲 (初入文壇)
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請(qǐng)問(wèn)如何用GenAlEx 基于 SSR 標(biāo)記計(jì)算多態(tài)性信息含量 PIC ? 已有1人參與
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
西門吹雪170: 金幣+3, 鼓勵(lì)回帖交流 2017-07-15 23:28:39
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西門吹雪170: 金幣+3, 鼓勵(lì)回帖交流 2017-07-15 23:28:39
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1、Cervus v3.0或者直接下載PIC-CALC計(jì)算程式。 2、多態(tài)信息含量（polymorphism information content，PIC）。 根據(jù)Bostein等（1980）。 多態(tài)信息含量是表示微衛(wèi)星DNA變異程度高低的一個(gè)指標(biāo)，反映微衛(wèi)星DNA多態(tài)高低，計(jì)算公式如下： PIC=1-∑pi2-∑∑2pi2pj2 式中：Pi、Pj分別為群體中第i、j個(gè)等位基因頻率，n為等位基因數(shù)。 |
2樓2017-07-15 21:22:36
zmrc
新蟲 (初入文壇)
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3樓2017-07-15 21:58:40
4樓2017-07-15 22:03:17
zmrc
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5樓2017-07-15 22:28:01
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您好，我也是做ssr，想用genalex軟件，但是不知道該軟件該如何統(tǒng)計(jì)ssr格式？我是按基因型統(tǒng)計(jì)的，可是軟件沒有這種輸入格式呢，求解答，謝謝 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
6樓2018-01-12 20:36:11
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