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timeless1100新蟲 (初入文壇)
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大家好，最近在做金屬離子配合物的時候遇到一些問題，希望能得到大家的幫助^_^ 已有1人參與
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大家好，最近在做金屬離子配合物的時候遇到一些問題，希望能得到大家的幫助^_^ 對于Cu2+與水和乙二胺（en）的絡(luò)合物：[Cu(H2O)6]2+、[Cu(en)(H2O)4]2+、[Cu(en)2(H2O)2]2+、[Cu(en)3]2+。由于Cu2+共有27個電子，水分子或乙二胺分子都是偶數(shù)個電子，所以整個體系默認采用開殼層計算。對其進行成鍵軌道分析（NBO）的時候,由于結(jié)果沒有顯示Cu--O鍵成鍵，然后用了”$CHOOSE”關(guān)鍵詞對其化學(xué)鍵進行指定，對于開殼層體系需要分別指定alpha電子和beta電子,例如下圖[Cu(H2O)6]2+，其部分輸入文件如下： $NBO $END $CHOOSE ALPHA LONE 1 9 2 1 4 1 6 1 8 1 10 1 12 1 END BOND s 1 2 S 1 4 S 1 6 s 1 8 s 1 10 s 1 12 s 2 3 s 2 19 s 4 5 s 4 17 s 6 7 s 6 18 s 8 9 s 8 16 s 10 11 s 10 15 s 12 13 s 12 14 END END BETA LONE 1 8 2 1 4 1 6 1 8 1 10 1 12 1 END BOND s 1 2 S 1 4 S 1 6 s 1 8 s 1 10 s 1 12 s 2 3 s 2 19 s 4 5 s 4 17 s 6 7 s 6 18 s 8 9 s 8 16 s 10 11 s 10 15 s 12 13 s 12 14 END END $END 現(xiàn)有如下的一些問題： 1、查閱文獻得到中心離子Cu2+應(yīng)該屬于SP3d2雜化，Cu--O鍵的成鍵是由Cu2+提供空軌道，O原子提供孤對電子。對于ALPHA和BETA下的LONE那兩行，在分別指定各個原子的未成鍵電子時，對于Cu2+，最外層應(yīng)該是17個電子，alpha電子和beta電子分別指定為9個和8個有問題嗎？如果有問題，對于提供空軌道的Cu2+該如何指定。 2、對于上個問題的NBO輸出文件應(yīng)如何分析其alpha軌道和beta軌道。 3、后期還需要做一些Zn2+與水和乙二胺絡(luò)合物的計算，此體系應(yīng)屬于閉殼層體系，這時候的NBO結(jié)果能和Cu2+的結(jié)果進行對比嗎？ 圖片2.jpg |
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【答案】應(yīng)助回帖
| 為什么要用CHOOSE指定。試試什么關(guān)鍵詞都不加，直接讓NBO程序自動確定lone pairs |
2樓2017-10-03 00:24:30
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送紅花一朵 |
你好，你的意思是不加choose關(guān)鍵詞，直接進行NBO計算嗎？還是說只是下邊的lone那行不寫？之前不加關(guān)鍵詞的時候算出來的結(jié)果沒有Cu-O鍵，所以才加的choose 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2017-10-08 07:09:57
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4樓2017-10-08 09:38:25
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5樓2017-10-08 11:02:12
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6樓2017-10-08 18:25:03
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明白你的意思了。沒有Cu-O鍵是因為Cu-O對應(yīng)的雙原子密度矩陣塊的布居數(shù)遠達不到2，從而無法構(gòu)建Cu-O的NBO軌道。這說明你的體系無法用經(jīng)典的Lewis結(jié)構(gòu)去描述，只能用共振式去描述。因此，應(yīng)該用NBO的NRT去算，關(guān)于這個我就不太熟悉操作了。 |
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7樓2017-10-18 21:01:10
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8樓2017-10-23 14:18:28
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