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damaoouba木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序過(guò)程中為什么要將富集的RNA隨機(jī)打斷成片段？ 已有1人參與
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| 這個(gè)地方我有點(diǎn)想不明白。為什么要將oligoDT富集的mRNA隨機(jī)打斷成片段之后再反轉(zhuǎn)成cDNA呢？有什么好處？如果不片段化會(huì)出現(xiàn)什么后果呢？ |
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一般測(cè)序都是幾百幾百的測(cè)，一次測(cè)的太長(zhǎng)后面就不準(zhǔn)了，所以打成隨機(jī)片段測(cè)序完了再拼接，保證準(zhǔn)確性。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
damaoouba2樓2017-10-09 11:48:25
damaoouba
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4樓2017-10-09 12:26:08
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5樓2017-10-09 12:34:37
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【答案】應(yīng)助回帖
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細(xì)胞里面一個(gè)基因mRNA不可能只有一條，多條都是隨機(jī)打斷是很容易通過(guò)軟件對(duì)比拼接的 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
6樓2017-10-09 12:36:40
chenj-315
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謝謝！還有一些疑問(wèn)，像一些單細(xì)胞測(cè)序的方法有一些mRNA含量可能也只有幾個(gè)拷貝，這種情況下通過(guò)軟件比對(duì)是否準(zhǔn)確率很低呢？ 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
7樓2017-10-09 12:48:04
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其實(shí)兩個(gè)都是可以拼接的，但是在高通量里面兩個(gè)拷貝的確容易出現(xiàn)不靠譜情況，但是幾個(gè)拷貝的話還是沒(méi)有什么問(wèn)題的。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
8樓2017-10-09 13:15:53
damaoouba
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9樓2017-10-09 13:18:47
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這個(gè)東西不好說(shuō)清楚，看一次視頻就能知道為什么了，網(wǎng)上可以搜到的，我們老師給我們放過(guò)。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
10樓2017-10-09 15:55:29
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