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[求助]
虛原子，固定3個原子在同一條直線下進(jìn)行優(yōu)化，然后失敗了 已有2人參與
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我在優(yōu)化構(gòu)型，希望22,27,29在同一條直線上進(jìn)行優(yōu)化，可是優(yōu)化錯誤顯示9999，并且無法再繼續(xù)。對優(yōu)化后的構(gòu)型的22和27的距離進(jìn)行掃描。這是我的輸入文件，請問有什么好的方法再進(jìn)行優(yōu)化？有人推薦說opt=modredundant之后在分子說明部分加上關(guān)于坐標(biāo)的限制這種方法可以試一下，可是該怎么操作啊？書我也沒看懂 ================================================================================================= %nprocshared=16 %mem=11900MB %chk=test1.chk #p opt=(calcall,z-matrix,maxcyc=400) m062x/6-31g(d) geom=connectivity freq xxxxxx 1 1 C C 1 B1 C 2 B2 1 A1 C 3 B3 2 A2 1 D1 0 C 4 B4 3 A3 2 D2 0 C 5 B5 4 A4 3 D3 0 C 4 B6 3 A5 2 D4 0 C 7 B7 4 A6 3 D5 0 C 8 B8 7 A7 4 D6 0 C 7 B9 8 A8 3 D7 0 H 1 B10 2 A9 3 D8 0 H 2 B11 1 A10 6 D9 0 H 5 B12 4 A11 3 D10 0 H 6 B13 5 A12 4 D11 0 O 9 B14 8 A13 7 D12 0 O 10 B15 7 A14 4 D13 0 N 10 B16 7 A15 4 D14 0 H 17 B17 10 A16 7 D15 0 N 7 B18 4 A17 3 D16 0 H 19 B19 7 A18 4 D17 0 N 7 B20 4 A19 3 D18 0 N 8 B21 7 A20 4 D19 0 C 21 B22 7 A21 4 D20 0 H 23 B23 21 A22 7 D21 0 H 23 B24 21 A23 7 D22 0 H 23 B25 21 A24 7 D23 0 H 22 B26 8 A25 7 D24 0 X 27 B27 22 90.000000 7 D25 0 C 27 B28 28 90.000000 22 -180.000000 0 H 29 B29 22 A28 8 D27 0 H 29 B30 22 A29 8 D28 0 N 29 B31 22 A30 8 D29 0 H 32 B32 29 A31 22 D30 0 H 32 B33 29 A32 22 D31 0 B1 1.37619528 B2 1.41726476 B3 1.42434668 B4 1.40078757 B5 1.38462037 B6 2.37065195 B7 1.43424378 B8 1.50281849 B9 2.45945595 B10 1.08484157 B11 1.09072045 B12 1.08252619 B13 1.08566267 B14 1.19806660 B15 1.19805965 B16 1.37517409 B17 1.01860062 B18 1.34978565 B19 1.01486698 B20 1.33769190 B21 1.29630383 B22 1.47377952 B23 1.09339318 B24 1.09006766 B25 1.08673695 B26 2.45189383 B27 4.93381600 B28 1.09192387 B29 1.09368068 B30 1.10361278 B31 1.45951100 B32 1.00000000 B33 1.00000000 A1 119.27322628 A2 119.90324334 A3 119.98021776 A4 118.76306282 A5 88.49774059 A6 88.38328217 A7 119.42215703 A8 90.81503102 A9 119.85870143 A10 120.98487658 A11 122.05198817 A12 118.65962201 A13 123.46247143 A14 146.46325558 A15 87.92140192 A16 115.48409631 A17 152.36695482 A18 122.74353874 A19 30.75481654 A20 122.41547660 A21 119.90500658 A22 110.39051514 A23 109.33284282 A24 108.77292706 A25 137.08351928 A28 108.48860242 A29 109.67003799 A30 107.06990745 A31 111.45302110 A32 110.02840744 D1 -0.95386644 D2 1.66649509 D3 -1.11927991 D4 178.06679013 D5 0.06236036 D6 -179.55414772 D7 177.97663600 D8 -179.69308152 D9 179.27722402 D10 177.06113362 D11 179.44408432 D12 -179.22357358 D13 -108.91489643 D14 70.06344768 D15 -179.78394356 D16 -175.77703225 D17 2.34781739 D18 174.38419320 D19 0.94246290 D20 -179.99010471 D21 -88.87625942 D22 33.55934657 D23 150.07518996 D24 175.80574903 D25 -126.95014287 D27 84.73264598 D28 -33.99463702 D29 -156.86320766 D30 -168.40093004 D31 68.76139017 1 2 2.0 6 1.5 11 1.0 2 3 1.5 12 1.0 3 4 1.5 22 1.5 4 5 1.5 21 1.0 5 6 2.0 13 1.0 6 14 1.0 7 8 1.5 19 1.5 21 1.5 8 9 1.0 22 2.0 9 15 2.0 17 1.0 10 16 2.0 17 1.5 19 1.0 11 12 13 14 15 16 17 18 1.0 18 19 20 1.0 20 21 23 1.0 22 23 24 1.0 25 1.0 26 1.0 24 25 26 27 28 1.0 28 29 1.0 30 1.0 31 1.0 29 30 31 32 1.0 33 1.0 32 33 1.png |
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
9樓2017-10-19 09:42:07
xueqingtao
新蟲 (正式寫手)
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- 專業(yè): 海洋工程
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9999錯誤一般為內(nèi)存不足，如果是TS優(yōu)化，試試opt=noeigentest，如果單純優(yōu)化結(jié)構(gòu)試試opt=calcall，我是這么處理的 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
2樓2017-10-17 19:15:59
3樓2017-10-18 09:46:40
zhou2009
版主 (著名寫手)
- QC強(qiáng)帖: 15
- 應(yīng)助: 337 (大學(xué)生)
- 貴賓: 4.053
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- 在線: 1274.7小時
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- 注冊: 2008-12-18
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
- 管轄: 量子化學(xué)
4樓2017-10-18 14:14:56
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