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[優(yōu)秀文章推薦]水稻穗型與產(chǎn)量基因表達(dá)調(diào)控研究獲新突破 已有3人參與
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中國科學(xué)家發(fā)現(xiàn)水稻的穗發(fā)育基因(FRIZZY PANICLE,F(xiàn)ZP)在自然界中發(fā)生變異,可顯著增加水稻每穗的粒數(shù)和輕微降低每粒的粒重,使水稻產(chǎn)量增加15%。基因表達(dá)調(diào)控是最重要的生物學(xué)現(xiàn)象之一,許多重要農(nóng)藝性狀都受基因表達(dá)調(diào)控;虮磉_(dá)調(diào)控元件,如“增強(qiáng)子”在玉米、水稻以及擬南芥等植物中均有報道。然而“沉默子”在植物中報道極為少見。本課題組通過近十年的研究,在水稻重要穗型發(fā)育基因FZP起始密碼子上游5.3 kb處鑒定到一個沉默子(18-bp的DNA序列),該沉默子的拷貝數(shù)變異調(diào)控FZP基因的表達(dá),影響水稻每穗穎花數(shù)與千粒重/粒形,進(jìn)而調(diào)控產(chǎn)量;進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子OsBZR1可結(jié)合該沉默子抑制下游基因FZP表達(dá)從而增加產(chǎn)量。 本課題組利用粒形差異巨大的水稻親本材料川7和豪博卡構(gòu)建的重組自交系群體,在第7染色體末端定位到一個同時控制每穗穎花數(shù)、千粒重與粒長的QTL(2010, BMC Genet)。研究人員通過精細(xì)定位將該QTL限定在一個17.8-kb區(qū)段,發(fā)現(xiàn)該區(qū)間與上述3性狀共分離,該區(qū)間只包含2個候選基因。研究人員將2個候選基因分別進(jìn)行轉(zhuǎn)基因或者突變體驗證功能,均未能證實它們是候選基因。通過進(jìn)一步分析該區(qū)間兩親本序列,研究人員發(fā)現(xiàn)存在一個18-bp的插入/缺失的位點,它位于穗發(fā)育基因FZP的上游,極有可能參與調(diào)控FZP的表達(dá)。研究人員將FZP基因序列與上游含5.3 kb的整個8.3-kb DNA序列克隆并進(jìn)行了遺傳互補(bǔ)轉(zhuǎn)化驗證,證實候選基因為FZP,功能位點為18-bp的多態(tài)位點。該18-bp序列可能是一個沉默子,它抑制下游FZP表達(dá)。FZP是重要的發(fā)育基因,它的功能缺失導(dǎo)致小花發(fā)育受阻,不能產(chǎn)生正常的種子。該課題組前期研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)ZP的編碼序列在自然資源里并不存在蛋白功能變異(2016,SREP)。自然界可能存在FZP的表達(dá)量變異,這種變異可能就是由這18-bp調(diào)控的。 該抑制是如何實現(xiàn)的呢?其分子調(diào)控機(jī)制是什么?這是擺在研究人員面前的又一科學(xué)問題。研究人員通過對該18-bp序列的motif結(jié)構(gòu)分析,也嘗試了酵母篩庫,同時查閱文獻(xiàn)。最終得出OsBZR1可能是該沉默子的結(jié)合靶蛋白。進(jìn)而通過系列實驗在體內(nèi)與體外證實它們存在互作,并進(jìn)一步驗證了OsBZR1通過結(jié)合該沉默子對下游報告基因具有轉(zhuǎn)錄抑制功能。2個拷貝的沉默子降低FZP表達(dá)量,每穗粒數(shù)顯著增加,千粒重略微降低,但稻米堊白率與堊白度顯著降低,提高了稻米蒸煮品質(zhì),產(chǎn)量顯著增加。多套近等基因系及RNAi轉(zhuǎn)基因材料產(chǎn)量數(shù)據(jù)表明:該沉默子通過抑制FZP表達(dá)使水稻單株產(chǎn)量增加15%以上,但不影響開花期。這與該小組之前克隆的Ghd系列基因增產(chǎn)但延長開花期不同。 該沉默子具有增產(chǎn)和改善稻米品質(zhì)的潛能,它是否很好地用于水稻育種呢?研究人員通過對529份世界水稻核心種質(zhì)材料測序分析發(fā)現(xiàn)該18-bp插入僅僅發(fā)生在東南亞的部分Aus品種中,說明這個突變起源于Aus品種,并未在我國主流高產(chǎn)品種中加以應(yīng)用。因此,該等位基因在我國具有極高的增產(chǎn)育種應(yīng)用前景。 |
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