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幽夜流星雨銀蟲 (初入文壇)
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[求助]
LAMMPS Tersoff提示出錯 已有1人參與
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我在用LAMMPS編寫銅在硅上沉積的過程中，使用了Tersoff style，然后提示Tersoff使用的不正確，找了好久問題沒找到，因此求教各位大神。錯誤如圖，代碼如下。其中加下劃線部分為提示出錯的地方，但是我認(rèn)為不應(yīng)該是這里的問題。 附in文件： #input file for copper deposition clear units metal dimension 3 atom_style atomic boundary p p f #Definition of the simulation box lattice fcc 5.43 region box block 0 20 0 20 0 22 create_box 4 box #Definition of mass mass 1 28 mass 2 28 mass 3 28 mass 4 63.5 #Definition of pair style and pair coefficient newton on pair_style tersoff pair_coeff * * Si.tersoff Si pair_coeff 3 4 Si.tersoff.modc Si Cu pair_style eam/alloy pair_coeff 4 4 Cu_u3.eam Cu #Definition of substrate atoms region substrate_down block 0 20 0 20 0 1 create_atoms 1 region substrate_down group fix_atoms region substrate_down region substrate_middle block 0 20 0 20 1 4 create_atoms 2 region substrate_middle group temperature_atoms region substrate_middle region substrate_up block 0 20 0 20 4 6 create_atoms 3 region substrate_up group mobile_atoms region substrate_middle neigh_modify delay 0 #Definition of the deposition atoms group Cu_atoms type 4 region atoms_region block 0 20 0 20 6 22 group atoms_region region atoms_region #Definition of the computation information compute atoms_temperature atoms_region temp compute_modify atoms_temperature dynamic yes extra 0 #Setting of other conditions fix 1 fix_atoms nve fix 2 temperature_atoms langevin 220 220 1 587283 fix 3 temperature_atoms nve fix 4 mobile_atoms langevin 220 220 1 587283 fix 5 mobile_atoms nve fix 6 Cu_atoms nve #Position of deposition atoms region slab block 0 20 0 20 16 22 # fix 7 Cu_atoms deposit 2200 4 100 12345 region slab near 4.0 & vz -0.0055 -0.0055 fix 8 Cu_atoms wall/reflect zhi EDGE thermo_style custom step atoms temp epair etotal press thermo 100 thermo_modify temp atoms_temperature lost/bond ignore lost warn dump 1 all atom 50 dump.deposit.atom #dump 2 all image 50 image.*.jpg type type & # axes yes 0.8 0.02 view 80 -30 #dump_modify 2 pad 5 dump 3 all movie 50 movie.mpg type type & axes yes 0.8 0.02 view 80 -30 dump_modify 3 pad 5 run 300000 錯誤.png |
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2樓2017-12-14 18:18:27
幽夜流星雨
銀蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
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3樓2017-12-15 22:55:03
4樓2018-01-14 18:20:20
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