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三百煩惱風(fēng)銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
autodock對接clusting聚類圖，能量分布很廣，很均勻，沒有主要構(gòu)象
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對接了50次，大概有十幾個(gè)能量，分布得特均勻，沒有主要構(gòu)象。這是為啥？是我對接過程有問題，還是小分子藥物根本沒有抑制效果？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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2樓2018-01-16 07:29:55
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盒子參數(shù)指的是grid box 的大小嗎？我設(shè)置的是包含原配體位置，盒子設(shè)置的90，90，90。是不是太大了不好。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2018-01-16 16:06:12
4樓2018-01-17 09:23:08
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嗯嗯，謝謝。我還想問下，如果最低能量構(gòu)象并不是clusting聚類中次數(shù)最多的構(gòu)象，那該選擇哪個(gè)作為對接能量？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
5樓2018-01-17 21:23:54
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我會選擇最低能量的構(gòu)象進(jìn)行分析，能量越低越穩(wěn)定的，法則 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
三百煩惱風(fēng)6樓2018-01-17 21:47:24
hclwonder
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7樓2018-01-17 22:56:17
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8樓2018-01-23 21:44:38
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