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sunshine???新蟲 (職業(yè)作家)
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[求助]
Pymol處理對(duì)接結(jié)果 已有1人參與
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1.pymol如何改變氨基酸殘基的Label的顏色，大小和位置 2.Pymol如何改變氫鍵的顏色，粗細(xì) 3.pymol如何改變distance的大小，位置和顏色 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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zyx335588
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
sunshine???: 金幣+10, ★★★很有幫助 2018-02-28 07:57:41
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1. （1）Label的大小，顏色和位置可以通過以下命令設(shè)置： set label_size, 14 #14，換成自己想設(shè)置的是大小 set label_color, red #red, 換成自己想設(shè)置的顏色 set label_position, (3,2,1) #(3,2,1)相對(duì)于原坐標(biāo)在x，y，z軸上的偏移量 （2）Label的位置可以手動(dòng)設(shè)置 點(diǎn)擊pymol窗口右下角的Mouse Mode，將3-Button Viewing模式更改成3-Button Editing模式 按住ctrl，鼠標(biāo)左鍵拖動(dòng)Label，可以移動(dòng) 按住ctrl和shift，鼠標(biāo)左鍵拖動(dòng)Label，可以在z軸上移動(dòng) label的詳細(xì)設(shè)置，見https://pymolwiki.org/index.php/Label 2和3每有搞懂需求。 2中的氫鍵是用什么表示的呢？虛線（dash，自動(dòng)找的）或者棍（stick，ligplot+導(dǎo)到pymol的），或者其他。 如果是虛線（dash），可以通過以下命令設(shè)置顏色，粗細(xì) set dash_color, red #red，換成你需要的顏色 set dash_radius. 0.25 #0.25, 換成你需要的粗細(xì)（寬度） 如果是棍（stick），也類似 set stick_color, red set stick_radius, 0.25 3中的distance是根據(jù)坐標(biāo)計(jì)算出來的，大小是不能改的，如果只是小數(shù)位數(shù)不同造成的四舍五入，可以用下面的命令更改 set label_distance_digits, 3 #3, 表示小數(shù)點(diǎn)后的位數(shù) distance的數(shù)字就是一個(gè)Label，顏色、尺寸等都可以使用設(shè)置Label的方式更改。 |
2樓2018-02-27 20:59:58
小鄭555
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3樓2018-03-19 20:51:45
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