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[交流]
amber創(chuàng)建拓撲報錯及找不到pdb4amber命令
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使用amber12+ambertools13的組合,由pdb文件創(chuàng)建拓撲文件時,會遇到“the file contained 575 atoms not in residue temples”以及“FATAL: Atom .R<NASP 1> A. <HB1 15> does not have a type”的錯誤,應該如何解決?是否需要reduce和pdb4amber兩個命令先處理pdb文件后再生成拓撲文件?但是我的tleap下找不到pdb4amber命令是為什么?非常感謝大神! 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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5樓: Originally posted by zmnhztt at 2019-01-09 15:08:50 請問樓主解決了嗎 我也遇到類似問題 請問你們解決了嗎,我有同樣的問題 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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2樓: Originally posted by 沙漠獵人 at 2018-03-19 13:00:44 可能是amber沒有裝好 你好!再請問一下,amber12+ambertools13這個組合,有pdb4amber的命令嗎?我在manual上沒找到…… 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
版主 (正式寫手)
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3樓: Originally posted by lcxw1224 at 2018-03-19 19:41:34 你好!再請問一下,amber12+ambertools13這個組合,有pdb4amber的命令嗎?我在manual上沒找到…… ... 應該是有的 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |

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