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poseidon008新蟲 (小有名氣)
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[求助]
十萬火急！reviewer的問題不知如何回答 已有2人參與
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我是用16s rRNA 高通量測序檢測微生物群落的變化，我們做高通量的結果通常都是用相對豐度的變化來表示某個屬的變化，但是reviewer的意思是去掉這部分內(nèi)容，這樣文章就少了一些內(nèi)容，不知道怎么解決才好，求高人指點 The relative abundance of the bacterial phyla and classes are not independent and cannot be compared directly with univariate statistics. Each of the phyla or classes are interrelated in a sample. I know that these types of comparisons have been completed in the past (in several papers) but we need to do it correctly. I suggest omitting this kind of statistics in the text。 |
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【答案】應助回帖
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poseidon0083樓2018-03-27 23:45:40
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審稿人意思可能是，每個種屬不能單獨進行比較，必須把樣品中所有屬數(shù)據(jù)拼接后進行比較，因為每個種的相對豐度是由其他種數(shù)量決定的 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2018-03-28 07:11:14
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5樓2018-03-28 07:12:09
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9樓2018-03-28 18:52:58
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我也是最近看R語言的資料發(fā)現(xiàn)它的這方面的應用。你看看這篇文章是不是講了，https://www.nature.com/articles/ismej2009112，我隨手搜的，還沒看全文 |
11樓2018-03-29 10:43:11
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6樓2018-03-28 07:30:49
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