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p天天天藍新蟲 (初入文壇)
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[求助]
NCBI BLAST和構(gòu)建發(fā)育樹，哪種方法能夠更準(zhǔn)確地確認(rèn)序列的種屬 已有1人參與
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求助！�。。� 最近在構(gòu)建發(fā)育樹的時候發(fā)現(xiàn)個問題：我自己擴增出來的序列（環(huán)境樣品），在NCBI上與已知種屬序列A的相似度到達98%�？墒窃跇�(gòu)建發(fā)育樹的時候，我自己擴增出來的序列，怎么都跟參考序列A建不到一簇，反而跟參考序列B建到一塊了（其中，參考序列A和參考序列B屬于同一個屬，但是不同種）。而與參考序列A的相似度僅為95%的序列，竟與參考序列A建到一簇了。為什么？？？？？ 1、細(xì)菌16S的序列，相似度為多少能歸到一個種？ 2、NCBI BLAST的結(jié)果與發(fā)育樹的結(jié)果為什么不能一一對應(yīng)？哪個方法更能確認(rèn)序列的種屬呢？ |
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p天天天藍
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7樓2018-04-18 08:34:32
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2樓2018-04-16 23:42:56
p天天天藍
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3樓2018-04-17 09:21:19
xp198766
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4樓2018-04-17 13:48:28
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