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[求助]
宏轉(zhuǎn)錄組學求助
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| 想做植物內(nèi)生菌宏轉(zhuǎn)錄組學,遇到一些問題,想求助各位大神。我們主要是想做植物根內(nèi)生菌的宏轉(zhuǎn)錄組學,第一是直接考慮送根組織(可以較好的保護內(nèi)生菌群的完整性)但是公司說,測序的時候植物對微生物的影響較大。我理解的是測序的時候會夾帶一些植物自身的測序數(shù)據(jù)。我知道宏基因組學是在數(shù)據(jù)處理的時候是可以過濾掉植物基因數(shù)據(jù)的。但是轉(zhuǎn)錄組學不知道能否可以。還有就是自己通過研磨根組織,然后用微孔徑的過濾膜把微生物過濾出來再提取,送公司進行測序。但是我理解的是這樣處理會造成微生物的豐度破壞。再怎么過濾也會有植物的破碎組織。想請教各位我應該怎么處理較好呢。或者其他更好的辦法,望各位推薦,不勝感激。 |
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