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浮生若驚夢(mèng)金蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助數(shù)據(jù)的處理，對(duì)照組為1時(shí)，對(duì)照組的標(biāo)準(zhǔn)偏差為啥不是0？ 已有1人參與
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| RT-PCR處理數(shù)據(jù)，柱狀圖中，用倍數(shù)表示各處理組與對(duì)照組關(guān)系時(shí)，對(duì)照組數(shù)值為1，但為何還有標(biāo)準(zhǔn)偏差？想知道具體原理和處理過程，望各位大佬不吝賜教！十分感謝！ |
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浮生若驚夢(mèng)
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2樓2018-05-16 20:31:53
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【答案】應(yīng)助回帖
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浮生若驚夢(mèng): 金幣+30, ★★★★★最佳答案, 講得很好！ 2018-05-16 23:53:15
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對(duì)照組的1其實(shí)是歸一化而來的，不是一個(gè)真實(shí)的表達(dá)量，而且是由對(duì)照組中的N個(gè)個(gè)體重復(fù)共同決定的，同樣是一個(gè)平均值，肯定也有標(biāo)準(zhǔn)差，那這個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差反應(yīng)的就是對(duì)照組的組內(nèi)差異！ 具體的計(jì)算：fold change這種計(jì)算的核心思想就是計(jì)算-ddCT時(shí)要減去對(duì)照組的平均值，這樣導(dǎo)致對(duì)照組都是每個(gè)個(gè)體減去自己的平均值，那么對(duì)照組的-ddCT的平均值是0，那么2-0次方的值就是1。所以最終的結(jié)果對(duì)照組平均值就是1，其他組是根據(jù)對(duì)照組計(jì)算而來，其實(shí)就是與對(duì)照組的比值，所以這種思想叫做fold change。 祝樓主實(shí)驗(yàn)順利！ |
3樓2018-05-16 23:05:59
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4樓2018-05-16 23:53:48
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西門吹雪170: 金幣+2, 鼓勵(lì)回帖交流 2018-05-17 07:52:25
西門吹雪170: 金幣+2, 鼓勵(lì)回帖交流 2018-05-17 07:52:25
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其實(shí)我說的歸一化也不準(zhǔn)確，這種計(jì)算方法是相對(duì)定量，都是相對(duì)于內(nèi)參基因的表達(dá)量，只是計(jì)算時(shí)都共同減了同一個(gè)數(shù)值（對(duì)照組平均值，或者所有組的平均值，或者最大值最小值都是OK的），所以具有了可比性。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
5樓2018-05-17 00:05:32
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6樓2018-05-17 10:05:48
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