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qewhuinqi新蟲 (正式寫手)
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[求助]
請(qǐng)問為什么會(huì)出現(xiàn)兩個(gè)基因的CDS序列一模一樣 已有2人參與
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前人報(bào)道A基因只在那一個(gè)部位表達(dá)，其他部位都沒有。但是我在另一個(gè)部位發(fā)現(xiàn)了一個(gè)和A基因的CDS一樣的序列，這是怎么回事 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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yanbodr
至尊木蟲 (文壇精英)
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2樓2018-06-02 11:21:59
用戶曉曉
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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1，不確定你說的部位是否是指不同的組織或者同一組織不同的部位。如果這樣的話，先要判斷你擴(kuò)增的那個(gè)基因與先前報(bào)道的是否是同一個(gè)基因（在染色體同一個(gè)位置）如果是同一個(gè)基因，那只是前人的研究結(jié)果不準(zhǔn)確。 2，就是 要確定你和前人的基因到底是不是同一個(gè)基因。不同的基因有完全一樣的CDS很正常的。很多基因在進(jìn)化過程中會(huì)出現(xiàn)基因拷貝，這樣就導(dǎo)致在染色體不同位置有編碼相同蛋白的不同基因。根據(jù)你的描述你說CDS相同，那么久可以通過用你們不同的材料的cDNA來擴(kuò)增這兩個(gè)基因的非編碼區(qū)。通過非編碼區(qū)的比對(duì)來確定是否確實(shí)存在兩個(gè)基因，還是這本來就是一個(gè)基因。（做實(shí)驗(yàn)之前可以先用CDS序列進(jìn)行下blast，看下基因組上是否有兩個(gè)位置都有完全的比對(duì)，如果是，那就說明這個(gè)基因存在完全一樣的一個(gè)或者多個(gè)拷貝；如果不是，適不能說明這個(gè)基因不存在拷貝的，因?yàn)榛蚪M序列并不是真理，可能存在組裝錯(cuò)誤，這時(shí)候就需要用試驗(yàn)來證明了） 祝試驗(yàn)順利！ |
3樓2018-06-02 13:40:19
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