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木棉和我木蟲 (職業(yè)作家)
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[求助]
分子動(dòng)力學(xué)中平衡構(gòu)象的抽樣處理(即時(shí)間平均)，有沒有便捷高效的方法？
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各位蟲友。文獻(xiàn)中提到：“RDF和CN是可以直接通過MD模擬軟件計(jì)算得出的，而想要更深入地了解體系的結(jié)構(gòu)，必須對(duì)其中的每個(gè)原子進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。分析所需要的原始數(shù)據(jù)是平衡狀態(tài)時(shí)所有原子所處的位置，為此，對(duì)每一組樣品，在最后的平衡弛豫過程中截取了1000個(gè)平衡構(gòu)象，提取每個(gè)構(gòu)象中每個(gè)原子的位置坐標(biāo)進(jìn)行后續(xù)分析，最后再將1000組結(jié)果進(jìn)行平均以滿足統(tǒng)計(jì)的有效性和精確性�！崩玑槍�(duì)O-Si-O鍵角分布，1000個(gè)平衡構(gòu)象都要分別進(jìn)行matlab處理，然后對(duì)結(jié)果進(jìn)行平均，這樣是否現(xiàn)實(shí)？有沒有更好的操作辦法？ [ Last edited by 木棉和我 on 2018-7-8 at 13:43 ]@smutao@oxox6085 |
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