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求一本書,專門介紹16s 測序極其結果處理 已有1人參與
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求一本書,專門介紹16s 測序極其結果處理 要是有這樣的書就好了 求大神幫助 |
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我們所說的16S 就是指 16S rDNA,所以,16S測序的大致邏輯就是: 拿到一個樣品,我們捕獲其16S區(qū)域(引物PCR),然后測序,16S既然有極好的保守性,那就可以用于鑒別不同的物種(相當于一個物種的獨一無二的條形碼)(有很大一部分是鑒定不到物種的)。 分析邏輯就是聚類成OTU,然后注釋(比對已知數(shù)據(jù)庫),后續(xù)分析。 Hiseq 的 16S分析流程已經(jīng)比較成熟了,網(wǎng)上能搜到一些pipeline。 PacBio的 16S分析可參考文章:High-resolution phylogenetic microbial community profiling |
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