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【轉(zhuǎn)帖】如何配置MS4.x的Cluster并行計算
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如何配置MS4.x的Cluster并行計算 以2節(jié)點配置為例。 1，安裝Centos 3.8 或 RHEL4.0 或其他linux 其中nfs rexec, rlogin, rsh 必裝，若不清楚的話選擇Everything 2, 二節(jié)點上都建立 msi 用戶如 msi (名字自己定), 注意兩個節(jié)點上的msi用戶對應(yīng)的密碼，GID要相同，否則無法節(jié)點間并行，并一般會提示 permission denied. 兩個用戶的shell 最好都用 csh 3, 在兩個節(jié)點上建立文件：/etc/hosts 和 /etc/hosts.equiv 如果已經(jīng)有這兩個文件則修改即可。如下 /etc/hosts: 127.0.0.1 node1 localhost.localdomain localhost (該行對有些軟件的并行會出問題，所以可以注釋掉或刪除) 192.168.0.1 node1 (IP自定義即可) 192.168.0.2 node2 /etc/hosts.equiv: localhost (該行對有些軟件的并行會出問題，所以可以注釋掉或刪除) node1 node2 4,node1上建立nfs服務(wù)，并發(fā)布共享目錄： (1)編輯或建立文件 /etc/exports 內(nèi)容如下： /home/msi *(rw, no_root_squash, sync) (2)發(fā)布共享目錄 運行： exportfs -rv (3)編輯或建立文件 /home/msi/.rhosts 內(nèi)容如下： node1 node2 5, node2節(jié)點上修改 /etc/fstab 在最后加入： node1:/home/msi /home/msi nfs defaults 0 0 注：以上系統(tǒng)文件操作都在root用戶下進行。 6,node1上安裝ms4.2, 注：使用msi用戶安裝，不要用root安裝，否則啟動ms網(wǎng)關(guān)時會提示無法啟動進程。 (我們通過nfs同時共享了軟件，所以，node2上可不裝ms4.2) 到安裝盤linux的文件目錄下運行： ./install --type cluster (我的node1就是主節(jié)點。軟件直接安裝在msi用戶主目錄下 一路下去，在選擇 hpmpi是否使用ssh時，選擇否，讓它默認使用rsh，否則后面配置ssh比較麻煩，對一般用戶來說用不著的。同時自動讓ms啟動網(wǎng)關(guān)服務(wù)，最后安裝程序還有提示如何將ms服務(wù)加到系統(tǒng)服務(wù)中，使得機子重啟后ms可以自動啟動. 這個請自行配置。 7，編輯 /home/msi/你的安裝目錄/share/data/machine.LINUX,輸入： (刪除或注釋掉原來的 localhost 行。) node1:2 node2:2 （進行計算機節(jié)點設(shè)置和每個節(jié)點的CPU數(shù)設(shè)置�！�2"指CPU線程數(shù)。即單科CPU 4 核的話就設(shè)置為4，而不是1） 8,檢查node1 和 node2 中的， nfs, rexec, rlogin, rsh 服務(wù)是否開啟。若未開啟則手動使用service命令開啟這些服務(wù)。如果不知道怎么手動開啟�？捎孟旅娴姆椒ǎ� root下運行 setup-》選擇 system service --> 看看這四項是否打上星號。沒有的話用空格鍵選上。 -->OK--> 重啟機子。(此時重啟對于node2也完成了下面第9步掛載nfs目錄的操作,所以可以跳過9) 9,在node2 中， root用戶下，mount nfs 服務(wù)目錄： #mount node1:/home/msi 10, 你現(xiàn)在應(yīng)該可以往node1 上提交任務(wù)，進行cluster并行計算了。若windows下的MS建立網(wǎng)關(guān)時識別兩個節(jié)點的CPU進程總數(shù)不對的話，檢查一下文件 /home/msi/安裝目錄/Gateway/root_default/dsd/conf/gw-info.sbd 文件里有一個地方設(shè)置CPU總數(shù)的，看看是不是不對。 11, 有可能需要啟動 lic_server 方法如下： 編輯或修改： node1 上 /home/msi/.cshrc 文件加入下面兩行： source /home/msi/軟件安裝目錄/Licensepack/etc/lp_cshrc lp_server -s 保存即可 12,對于大于2個節(jié)點以上的，其他node3，node4，。。。節(jié)點同node2配置即可。 注：如果你現(xiàn)在還分不清楚root和一般用戶，則建議先學(xué)習(xí)linux系統(tǒng)。 http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=33755 |
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zdhlover7樓
2009-12-13 16:28
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