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qzhaosdu金蟲(chóng) (著名寫手)
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[交流]
【求助】structure factor S(q)的問(wèn)題 已有2人參與
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看好多文獻(xiàn)上都有structure factor 這個(gè)量的分析,但是一直不知道是怎么做出來(lái)的,定義也都不一樣?磿虾孟袷菍(duì)g(r)積分然后再乘上密度啥的。 這個(gè)量gmx或者namd有現(xiàn)成的程序可以做嗎?或者是要自己做福利葉變換? 還有個(gè)問(wèn)題,這個(gè)量是對(duì)于某種分子來(lái)說(shuō)的呢,還是對(duì)于整個(gè)體系呢?我看有的圖是分析一種的,還有的圖也沒(méi)指明。 [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:22 ] |

木蟲(chóng) (小有名氣)
金蟲(chóng) (小有名氣)
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結(jié)構(gòu)因子(structure factor)是表征材料對(duì)射線的散射能力,包括了原子序數(shù),散射方向和原子位置的影響等等,反映了材料結(jié)構(gòu)的平均信息。實(shí)驗(yàn)中可以獲得結(jié)構(gòu)因子,通過(guò)傅立葉變換獲得徑向分布函數(shù)(RDF)。分子模擬則相反,先獲得RDF,再通過(guò)變換獲得結(jié)構(gòu)因子。 不知道你說(shuō)的對(duì)某個(gè)分子是什么意思,是不是指偏徑向分布函數(shù)(partial RDF)?模擬很容易計(jì)算。實(shí)驗(yàn)就比較麻煩,得看你的成分。比如說(shuō)合金(兩種元素),就得三組不同實(shí)驗(yàn)(X-ray,中子和電子),然后才能計(jì)算partial RDF。 就知道這么多了,不對(duì)的地方歡迎討論。 ![]() [ Last edited by 海邊看日出 on 2009-7-6 at 11:46 ] |
金蟲(chóng) (著名寫手)

鐵桿木蟲(chóng) (著名寫手)
鐵蟲(chóng) (職業(yè)作家)
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您好,想向您請(qǐng)教關(guān)于模擬中的結(jié)構(gòu)因子問(wèn)題。 模擬文獻(xiàn)經(jīng)常出現(xiàn)結(jié)構(gòu)因子分析,也就是RDF傅里葉轉(zhuǎn)換后的曲線圖中,特征峰對(duì)應(yīng)的橫坐標(biāo)位置常常表現(xiàn)為一個(gè)一定尺寸大小的周期性團(tuán)簇,(比如 a broad peak around 1.5A-1 at 5 wt% swollen menbrane corresponds to the 3-5 A periodicity of sulfonic acids. )這個(gè)尺寸(3-5 A)是如何計(jì)算出來(lái)的呢? 有特定公式表征么? 謝謝! |
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