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[資源]
【原創(chuàng)】Cartes 1.3.5 免費(fèi)版【已搜無重】
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小木蟲上有人曾提供過Cartes的下載資源，但都不是最新版本的。這個(gè)特將Cartes 1.3.5 免費(fèi)版?zhèn)魃蟻怼?br />
注：Windows Vista使用注意：將cartes.exe的兼容模式改成Windows XP，并從用“管理員運(yùn)行模式”。 1、Cartes軟件的功能： Cartes軟件是對分子和晶體的結(jié)構(gòu)進(jìn)行編輯和操作的強(qiáng)大工具，它可以幫助人們解決在進(jìn)行理論和計(jì)算化學(xué)研究時(shí)模型構(gòu)造中所遇到的困難。下面我們將看到，Cartes有著許其他分子結(jié)構(gòu)編輯軟件所沒有的功能和優(yōu)點(diǎn)，如果能結(jié)合諸如Chem3D, GaussView等軟件輔助使用，通常的分子結(jié)構(gòu)構(gòu)造都能輕松完成。總體來說，Cartes的功能有： （一）晶體坐標(biāo)變換 (1)晶體的分?jǐn)?shù)坐標(biāo)轉(zhuǎn)化成直角坐標(biāo)。 (2)晶體的直角坐標(biāo)轉(zhuǎn)化成分?jǐn)?shù)坐標(biāo)。 (3)生成向ａ,ｂ,ｃ三個(gè)方向堆積i,j,k個(gè)晶胞的全部分?jǐn)?shù)坐標(biāo)或直角坐標(biāo)。 (4)生成按照給定對稱性關(guān)系得出的所有相關(guān)原子的分?jǐn)?shù)坐標(biāo)或直角坐標(biāo)。 (5)按照空間群的對稱性由不等價(jià)原子推出一個(gè)晶胞內(nèi)所有原子的坐標(biāo)。 (6)查看空間群信息，包括國際空間群符號(hào)，Schonflies標(biāo)記，晶系，Wyckoff位置以及所有對稱性等價(jià)位置等。 (7)自動(dòng)轉(zhuǎn)換*.cif文件：從*.cif文件中讀取選定結(jié)構(gòu)，然后自動(dòng)將其轉(zhuǎn)換成包含一個(gè)完整晶胞的坐標(biāo)文件。 （二）分子坐標(biāo)變換 (1)按照指定對稱操作任意平移、旋轉(zhuǎn)、反映或反演當(dāng)前的坐標(biāo)。 (2)將一組坐標(biāo)的中心平移到原點(diǎn)。 (3)判斷分子的點(diǎn)群，并顯示主要對稱元素（如旋轉(zhuǎn)軸的軸向矢量，對稱面的法向矢量等等）。 (4)自動(dòng)調(diào)整分子取向，包括： 1)自動(dòng)將分子的主軸調(diào)整到x,y,z軸上。 2)自動(dòng)將分子的自定義的某個(gè)軸調(diào)整到自定義的另外一個(gè)軸上。 （三）各種文件格式的轉(zhuǎn)換 (1)可導(dǎo)入的直角坐標(biāo)文件格式有： Gaussian Job Files (*.gjf) XYZ Coordinate (*.xyz) Brookhaven PDB Files (*.pdb,*.ent) Crystallographic Information Files (*.cif) MDL MOL Files (*.mol,*.sdf,*.sd,*.mdl) InsightII CAR Files (*.car)|*.car Cambridge Crystallographic (*.csd,*.fdat,*.dat) Quanta Files (*.msf) Sybyl MOL2 Files (*.mol2) Cerius2 Files (*.msi) Catalyst Files (*.cpd) Catalyst Query Files (*.chm) MDL Sketch (*.skc)|*.skc InsightII Grid Files (*.grd) DS ViewerPro Files (*.msv) (2)可導(dǎo)入的分?jǐn)?shù)坐標(biāo)文件格式有： Gaussian Job Files (*.gjf) Crystallographic Information Files (*.cif) (3)可導(dǎo)出的直角坐標(biāo)文件格式有： Gaussian Job Files (*.gjf) XYZ Coordinate (*.xyz) Brookhaven PDB Files (*.pdb,*.ent) MDL MOL Files (*.mol,*.sdf,*.sd,*.mdl) Catalyst Files (*.cpd) Catalyst Query Files (*.chm) VRML World Files (*.wrl) Smiles Files (*.smi) GIF Files (*.gif) JPEG Files (*.jpg) DS ViewerPro Files (*.msv) (4)可導(dǎo)出的分?jǐn)?shù)坐標(biāo)文件格式有： Gaussian Job Files (*.gjf) 2、Cartes軟件的特色 （一）自動(dòng)識(shí)別點(diǎn)群 象Chem3D這樣專業(yè)的軟件目前尚沒有自動(dòng)識(shí)別點(diǎn)群的功能，而GaussView的3.07以來的版本已經(jīng)增加了此項(xiàng)功能，但是其準(zhǔn)確程度令人擔(dān)憂。似乎GaussView傾向于低估分子的對稱性，例如它往往無法判斷出高于6重軸的對稱性，如碳管(7,7)，GaussView給出的點(diǎn)群是C2h，而實(shí)際是D7d；又比如碳管(5,5)，它認(rèn)為其點(diǎn)群是C5，而實(shí)際是D5d。 可見自己動(dòng)手寫一個(gè)自動(dòng)識(shí)別點(diǎn)群的程序是很具有挑戰(zhàn)性的，于是我就寫了這樣的程序，現(xiàn)在正好把它集成到Cartes軟件里來了。 （二） 自動(dòng)調(diào)整分子取向 自動(dòng)將分子的主軸調(diào)整到x,y,z軸上。 自動(dòng)將分子的自定義的某個(gè)軸調(diào)整到自定義的另外一個(gè)軸上。 （三）對稱操作矩陣自動(dòng)生成向?qū)?br /> 在進(jìn)行對稱操作時(shí)，原先需要自行輸入變換矩陣，這往往要求用戶自己推求矩陣元，因而極為不方便。 現(xiàn)在我加入了對稱操作矩陣自動(dòng)生成向?qū)В梢允址奖愕匕凑諏ΨQ變換自動(dòng)生成變化矩陣。我想這是一個(gè)令人振奮的改進(jìn)！ （四）通過空間群自動(dòng)添加操作矩陣 嚴(yán)格按照各個(gè)空間群的對稱性關(guān)系自動(dòng)來添加對稱操作矩陣，這應(yīng)該是繼對稱操作矩陣自動(dòng)生成向?qū)е笥忠粋�(gè)明顯方便有效的改進(jìn)。 （五） 高精度的運(yùn)算和轉(zhuǎn)換 Chem3D雖然有旋轉(zhuǎn)等對稱操作，但轉(zhuǎn)換的精度有時(shí)并不能滿足需要，往往破壞了對稱性，而Cartes的精度高達(dá)小數(shù)點(diǎn)后14位，任意次的轉(zhuǎn)換仍然能保持原有的點(diǎn)群對稱性。 （六）多種文件格式的兼容和互轉(zhuǎn) 如果有可能的話，以后我還會(huì)兼容其他文件格式——比如Gaussian等量化軟件的out文件等等。 （七） 語言切換 有中文和英文兩種語言的支持。 （八） Office XP界面 另外還采用了真彩色菜單的技術(shù)，進(jìn)一步美化了界面。 （九） 綠色軟件 無需安裝，直接運(yùn)行，不產(chǎn)生垃圾文件，不對注冊表進(jìn)行操作。 |
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2樓2009-07-20 22:32:04
4樓2010-03-11 19:38:43
5樓2010-03-15 08:34:12
簡單回復(fù)
lz8306173樓
2009-07-21 20:22
回復(fù)
謝謝分享！
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