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redskywei木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[交流]
【求助】siesta3.0 算輸運(yùn)，怎么能像atk那樣方便的加多個(gè)電壓？ 已有4人參與
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今天看了一下sieata3.0的手冊(cè)，對(duì)于加偏壓的說(shuō)明很少，就一個(gè)TS.Voltage 的參數(shù)說(shuō)明。但是如果要算iv曲線，肯定要很多的偏壓點(diǎn)才行，怎么才能讓他像transieta-c那樣，可以用一個(gè)循環(huán)不停的計(jì)算各個(gè)設(shè)定好的偏壓下的輸運(yùn)特性呢？？？？ 請(qǐng)高手不吝指教。呵呵 [ Last edited by redskywei on 2009-11-2 at 21:49 ] |
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zhangguangping
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
zxzj05(金幣+3):謝謝你的參與 2010-04-11 21:08
小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
zxzj05(金幣+3):謝謝你的參與 2010-04-11 21:08
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我的操作系統(tǒng)是SUSE的，我把我的也貼在這個(gè)地方，以供大家參考！其中計(jì)算下步的時(shí)候都用的是上一步的.TSDE文件，因?yàn)檫@是transiesta的密度矩陣。由于我們計(jì)算的偏壓范圍不是很大，對(duì).TSDE的影響不至于相差甚遠(yuǎn)。用前面的密度矩陣，做下一個(gè)計(jì)算的密度矩陣初始猜測(cè)，這樣不但節(jié)省了siesta計(jì)計(jì)算.DM的時(shí)間，還同時(shí)加快了.TSDE的收斂時(shí)間（最好是再算電壓的的循環(huán)里面偏壓點(diǎn)要按照順序排列，這樣能更加有效的節(jié)省時(shí)間） --------------------------------------- Filename="scat.fast" #define the name of the inputfile mpirun -np 8 transiesta < $Filename-0.0.fdf > sr-0.0.log mpirun -np 8 tbtrans < $Filename-0.0.fdf > tb-0.0.log tail -n3 tb-0.0.log |head -n1|cat >>iv.log oldbias=0.0 SystemLabel="SystemLabel scat.fast" #define the name of the outputfile for bias in -0.2 -0.1 0.1 0.2 #define the bias to be calculated one by one best in sequence do cp $Filename-$oldbias.TSDE $Filename-$bias.TSDE sed -e "s/TS.Voltage $oldbias eV/TS.Voltage $bias eV/g" -e "s/$SystemLabel-$oldbias/$SystemLabel-$bias/g" $Filename-$oldbias.fdf > $Filename-$bias.fdf mpirun -np 8 transiesta < $Filename-$bias.fdf > sr-$bias.log mpirun -np 8 tbtrans < $Filename-$bias.fdf > tb-$bias.log tail -n3 tb-$bias.log |head -n1|cat >>iv.log oldbias=$bias done --------------------------------------- 最后把的到的電流電壓點(diǎn)都給匯總到iv.log文件中，并且每個(gè)偏壓點(diǎn)的信息都不會(huì)被下一步計(jì)算覆蓋！Filename定義你的任務(wù)輸入文件的名稱，SystemLabel和你的FDF中的SystemLabel一致，并且在計(jì)算每個(gè)偏壓的時(shí)候都會(huì)在這個(gè)標(biāo)簽的基礎(chǔ)上加上一個(gè)偏壓后綴，來(lái)卻分不同偏壓的輸出結(jié)果！ 希望對(duì)蟲(chóng)子們有用！ 在此非常感謝xhsh的奉獻(xiàn)！我是在xhsh的腳本基礎(chǔ)上（發(fā)現(xiàn)在我的機(jī)器上沒(méi)法執(zhí)行，），自己修改了一下！ [ Last edited by zhangguangping on 2010-4-11 at 00:27 ] |
15樓2010-04-11 07:23:04
2樓2009-11-02 15:52:35
redskywei
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3樓2009-11-02 21:46:50
redskywei
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4樓2009-11-03 10:28:55
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