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【求助】關(guān)于checkcifA類問題求助 已有1人參與
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這是我第一次check,有好多都不懂，希望高手們多多耐心指教，我先謝謝大家啦 A類錯誤如下： 1、Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... OW2 2、A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... OW1 3、 Check Reported Molecular Weight ................ 162.88 4、 Mu(calc) and Mu(CIF) Ratio Differs from 1.0 by . 68.47 Perc. 5、A (Proper) Absorption Correction Method Missing .. ? 6、A Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ... ? 7、A Medium Crystal Dimension Missing (or Error) ... ? 8、A Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ... ? 9、A No H-atoms, but _solution_hydrogens reported as geom 10、A No H-atoms, but _hydrogen_treatment reported as mixed 11、A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........ ? |
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美麗的喬(金幣+10):謝謝你，我再試試 2010-03-19 09:48
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1、傅里葉加氫：把ins中PLAN值改為50或者更大，精修一次以后，仔細(xì)尋找氧原子周圍較大的Q峰，再根據(jù)氫鍵的方向，把相應(yīng)的Q定為氫以后，在ins中加入指令 DFIX 0.85 0.01 O1W H11 O1W H12 DFIX 1.39 0.01 H11 H12 精修即可。 2、理論加氫：在XP中輸入FMOL,然后回車，輸入join O1W 再加一個母體原子 這樣就將氧原子和其他原子強(qiáng)行連接起來，然后輸入HADD 3 O1W FILE 保存即可，產(chǎn)生S.ins文件，將其中的三個氫考入res文件，再根據(jù)氫的方向殺掉一個，保存，精修即可。 |
4樓2010-03-18 21:30:47
244073931
至尊木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 19 (小學(xué)生)
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- 專業(yè): 金屬有機(jī)化學(xué)
美麗的喬(金幣+10):謝謝你，能不能介紹一下H2O加氫的過程，多謝啦，要是你能幫我解決A類錯誤，30個都給你啦，不夠還可以再加，我的QQ:979127952,多謝啦 2010-03-18 16:33
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1. OW2沒有加氫（H2O） 2.OW1沒有加氫（H2O） 3.分子量問題，CIF中給出的和實(shí)際晶胞中的不一致造成的，在INS文件中改正 4.吸收系數(shù)也是3中的原因造成de 5.在CIF文件的Absorption Correction Method 填上如multi-scan 678 填上晶體的尺寸（按大小長寬高各多少） 9 10 吧cif文件中的加氫mixed改為constr 11.填上晶系和空間群 這是OK |
2樓2010-03-18 16:11:52
3樓2010-03-18 16:43:11
6樓2010-03-19 10:31:15
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