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【原創(chuàng)】ABINIT的一種晶體結構建模方法
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以前,在論壇上看到不少帖子,ABINIT的建模方法都是采用natom+rprim+xred+acell來進行建模的,這包括abinit的說明中的例子也是這樣。因此,這需要預先用MS建立晶體結構,然后make P1,再導出坐標,然后才能計算。 這里,介紹一種用natom+natrd+spgroup+brvltt+acell+angdeg+xred進行建模的方法 這種建模方法和MS的利用空間群和等效的晶體學位置進行建模的方式是一致的,個人感覺挺方便的。 具體參數的意義可在www.abinit.org中找到。 以PRL 100,186402的一篇文章為例,La2NiMnO6的晶體學數據如下表所示 ![]() 我們用Monoclinic型為例子,其晶胞有20個原子,因此建模部分如下 spgroup 14 ntypat 57 28 25 8 natom 20 brvltt -1 natrd 6 #讀入的原子數目,就是晶體學數據給出的有坐標的原子數目 typat 1 2 3 4 4 4 #表中給出的Monoclinic型La2NiMnO6晶體的數據分別是 # La Ni Mn O1 O2 O3 acell 5.467 5.510 7.751 Angstrom #用埃做單位后面要加上Angstrom #也可用Bohr做單位 angdeg 90.000 90.119 90.000 xred ![]() [ Last edited by identation on 2010-4-8 at 23:57 ] |
Abinit 相關資料 | 有意思的 | Abinit及相關小程序 |
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(1)這種方法是采用 crystal builder 方法。 必須保證 spgroup不等于0。也就是說必須自己設定值,abinit默認為0。我看你的input里面沒有輸入 (2)這種方法的缺點是:對于摻雜(特別是無序),這種輸入方式無法建模。 只能用unit cell 或者primitive cell (對于個別有序情況) 全部原子輸入方式 [ Last edited by wenjlu on 2010-4-8 at 22:12 ] |



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