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hometownlove金蟲 (小有名氣)
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[交流]
【活動(dòng)】各種量子力學(xué)計(jì)算軟件使用經(jīng)驗(yàn)談(回復(fù)就有獎(jiǎng)勵(lì),講述詳細(xì)的獎(jiǎng)勵(lì)5-10金幣) 已有29人參與
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當(dāng)前,量子力學(xué)計(jì)算越來越普及,量子力學(xué)計(jì)算軟件也越來越多,包括MS、Vasp、Wien2k、ab init、Siesta、pwscf、Gaussian、ADF等。 如何讓新入門的研究人員對各個(gè)計(jì)算軟件的應(yīng)用方向和領(lǐng)域、計(jì)算的優(yōu)缺點(diǎn)有一個(gè)詳細(xì)的了解,在自己做計(jì)算時(shí)少走彎路,特發(fā)起本次活動(dòng),希望廣大蟲友多多支持。 一般性的描述和區(qū)別網(wǎng)絡(luò)上可能都有,希望廣大蟲友側(cè)重于自己在計(jì)算摸索中總結(jié)的經(jīng)驗(yàn)、心得和體會(huì),這方面的將會(huì)予以重獎(jiǎng)。 因?yàn)橛?jì)算不同的性質(zhì)如光、熱、電、磁、力等性質(zhì)時(shí),各個(gè)軟件肯定都有自身所擅長和所側(cè)重的。 歡迎大家踴躍發(fā)言! [ Last edited by hometownlove on 2010-4-21 at 09:05 ] |
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量子力學(xué) | @個(gè)人收集@ | 計(jì)算模擬 | 模擬計(jì)算 |
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金蟲 (小有名氣)
| 現(xiàn)在常用的第一性原理計(jì)算軟件中最容易上手的就是MS,雖然它有很多缺點(diǎn),比如說贗勢不好,精度不高,源代碼不開放等等,但是對于一般的科研工作而言就夠用了,畢竟我們做計(jì)算的目的是尋求規(guī)律,解釋現(xiàn)象,探求本質(zhì),而不是一味追求高精度。精度再高也是理想狀態(tài),也無法實(shí)現(xiàn)復(fù)雜實(shí)驗(yàn)條件的模擬。至于文章中圖譜的效果、好看與否,更大程度上在于個(gè)人對于數(shù)據(jù)的理解程度、后續(xù)分析及數(shù)據(jù)處理,而不是軟件本身了。從這個(gè)角度講,ms則是一款比較實(shí)用的軟件,把時(shí)間和精力用于軟件的開發(fā)和學(xué)習(xí)還不如用來加深理論功底和數(shù)據(jù)分析!一點(diǎn)拙見而已。 |
至尊木蟲 (文壇精英)
學(xué)習(xí)者
| MS中包括Visualizer、CASTEP、Dmol3、VAMP、 Discover、 Amorphous Cell、Compass等多個(gè)建模和計(jì)算軟件,可進(jìn)行晶體、非晶電子結(jié)構(gòu)的量子力學(xué)計(jì)算,也可進(jìn)行分子的量子力學(xué)計(jì)算;可進(jìn)行材料的分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算;可進(jìn)行x-ray衍射計(jì)算;能夠處理稀土元素,功能強(qiáng)大,就是貴。有Linux和Windows版本,便于學(xué)習(xí)。 VASP 具有很好的贗勢,與CASTEP相似,使用平面波基組。 Wien2k是全電子計(jì)算的量子化學(xué)軟件,處理磁性材料較好。abinit、 Siesta是免費(fèi)軟件,提供原代碼。處理重金屬不準(zhǔn),缺乏相應(yīng)的贗勢。用于計(jì)算晶體的電子結(jié)構(gòu)。 Gaussian主要用于分子、離子的計(jì)算,可處理激發(fā)態(tài),精度高,耗資源。 |

木蟲 (著名寫手)
葉落鷹飛
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vasp由于優(yōu)化算法比較好,計(jì)算速度較快,計(jì)算時(shí)問題出現(xiàn)較少,需要控制的參數(shù)也不是很多。而且他還有比較獨(dú)特的paw勢,在dft平面波的軟件中,日漸趨于主流軟件。其功能也在逐漸完善。發(fā)展?jié)摿艽蟆?br />
abinit計(jì)算軟件,我感覺其功能還是很強(qiáng)大的(可以說其它第一性原理軟件能計(jì)算的性質(zhì),它基本都沒問題,而且它的gw和dfpt獨(dú)特功能),計(jì)算速度也不是很慢。只是用起來太麻煩,控制參數(shù)繁多,入門很慢。 至于再具體的,很多時(shí)候就得具體的問題,具體分析了。 |

木蟲 (著名寫手)
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現(xiàn)在很多第一性原理計(jì)算的軟件都要在Linux環(huán)境下編譯運(yùn)行,這對于習(xí)慣了Windows的用戶是一個(gè)比較大的難題,入門總比較慢! VASP確實(shí)已經(jīng)成了一個(gè)主流軟件,而CASTEP仍有余威,CASTEP目前集入MS中,可以在Windows環(huán)境下運(yùn)行,無疑為入門者提供極大的方便,但是不得不提的是在使用的過程中有很多的缺陷! 值得注意的是目前計(jì)算精度很高的全電勢計(jì)算軟件如FP-LAPW、LMTO,目前正越來越受歡迎。希望大家能共同關(guān)注! |
木蟲 (正式寫手)
star watcher
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flapw中強(qiáng)烈推薦elk,主要優(yōu)點(diǎn):代碼清晰,容易了解計(jì)算原理。后處理極為簡單,像畫能帶圖時(shí),會(huì)自動(dòng)給出高對稱點(diǎn),使用自帶的elkband可以很容易得到能帶圖而不用復(fù)雜的后處理過程。同時(shí)可以處理的性質(zhì)比較多。 缺點(diǎn):文檔太少。只有一個(gè)輸入說明,不適合新手。不過官方論壇提問作者一般都會(huì)回答。再就是為方便后處理,輸出文件比較多,使用前最好看下給的相關(guān)例子。再就是目前不支持mpi(可以用openmp并行),對聲子不能用dfpt。 |
木蟲 (著名寫手)
木蟲 (小有名氣)
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綴加球面波方法-ASW 這個(gè)軟件是在量子化學(xué)網(wǎng)上看到的,之前一直都在使用abinit,但是苦于我要計(jì)算的體系所含元素的贗勢不全,所以就嘗試使用ASW。但是目前至少在小木蟲上發(fā)現(xiàn)使用此軟件的人極少。ASW程序的執(zhí)行文件需要通過郵件向volker Eyert申請。 我總結(jié)ASW的特點(diǎn):計(jì)算速度快;輸入文件只有一個(gè)而且相對簡單;磁性計(jì)算比較全面:包括無磁、鐵磁、反鐵磁。當(dāng)然個(gè)人認(rèn)為它最大的一個(gè)優(yōu)點(diǎn)就是作者編寫了很多計(jì)算和后期作圖的腳本,使用很方便,特別是處理分波態(tài)密度時(shí)相當(dāng)輕松。另外目前也發(fā)現(xiàn)了一些問題:個(gè)人感覺ASW對計(jì)算體系的結(jié)構(gòu)尤其是對稱性方面有很嚴(yán)格的限制,并不像VASP或是ABINIT那樣相對寬松,還有就是它的優(yōu)化功能不是很全面,可能是我使用的還不是很熟練地原因。 |

金蟲 (小有名氣)

金蟲 (正式寫手)

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