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microdiag鐵蟲 (初入文壇)
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[交流]
【原創(chuàng)】疾病相關(guān)SNP，突變和甲基化檢測(cè)新方法 已有1人參與
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現(xiàn)階段,大家檢測(cè)SNP時(shí)都用一貫的檢測(cè)方法,包括測(cè)序,探針還有DHPLC等等,而甲基化大多用MSP.至于HRM技術(shù)(高分辨率溶解曲線技術(shù))并不為大家所熟知,有兩個(gè)原因:1)適合做HRM技術(shù)的儀器太少了,而且在國內(nèi)的普及程度不高,具我了解能夠做HRM的有Roche LightCycler 480,Qiagen Roter-Gene 6000,ABI 7500 Fast和ABI7900HT Fast,Idaho LightScanncer.其中羅氏的480在其軟件分析上是做的最好的.2)HRM的實(shí)驗(yàn)靈敏度太高,影響實(shí)驗(yàn)因素過多,很多人都做了,但是就是做不出來.因此就放棄,就換用其他比較成熟的方法.殊不知,HRM技術(shù)的檢測(cè)方法有其他技術(shù)難以比擬的優(yōu)勢(shì)，不僅能實(shí)現(xiàn)高通量和高精度的同時(shí),PCR和熒光定量在同一管內(nèi)進(jìn)行,能夠有效避免假陽性. 作為新一代的遺傳掃描工具,HRM具有"簡(jiǎn),效,快,廉"等其他技術(shù)難以比擬的優(yōu)勢(shì): 簡(jiǎn):無需序列特異性探針,不受堿基位點(diǎn)局限,同時(shí)檢出已知或未知突變、SNP和甲基化位點(diǎn)：閉管操作，避免交叉污染。 效：最低檢測(cè)0.1%-0，01%的突變或異常甲基化，檢測(cè)SNP靈敏度和特異性均為100%。 快：1次同時(shí)不多于384個(gè)樣本，在60-90分鐘內(nèi)完成檢測(cè)。 廉：簡(jiǎn)化操作步驟、降低人工和試劑成本，費(fèi)用遠(yuǎn)少于測(cè)序、Taqman探針等方法。 HRM技術(shù)特別適用于樣本量多、檢測(cè)位點(diǎn)較少的SNP、突變或甲基化分析，是不同于基因芯片檢測(cè)方法（檢測(cè)位點(diǎn)多，樣本少）的高通量方法。同時(shí)，也是基因芯片篩選后的多個(gè)基因在更多標(biāo)本中驗(yàn)證的最佳方法。 |
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fywjp
木蟲 (正式寫手)
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- 性別: GG
- 專業(yè): 生物化學(xué)
2樓2010-05-06 08:52:02
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