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longchang金蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】dmol運(yùn)行問(wèn)題 已有2人參與
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用dmol計(jì)算一體系,由于體系較大,先用coarse計(jì)算.GGA-Pw91,DSPP,其它采用默認(rèn),但在計(jì)算的過(guò)程中出現(xiàn): Message: SCF converged df ATOMIC COORDINATES (au) DERIVATIVES (au) df x y z x y z df × 0.000000 0.000000 0.000000 0.000179 0.002410 0.209700 df × -0.001942 0.003523 6.109414 -0.013102 0.008138 -0.141890 df × 0.001656 0.025382 12.198009 ************************** df × 6.105705 3.525130 3.030176 0.003279 0.002343 -0.032384 df × 6.099199 3.526706 9.188596 288.960006 207.322856 151.985895 df × 6.105705 0.000000 0.000000 0.000593 -0.001446 0.210636 df × 6.106077 0.001966 6.107801 0.017212 -0.014114 -0.189472 df × 6.111290 0.004171 12.204739 ************************** df × -6.105705 3.525130 3.030176 -0.001875 0.001881 -0.029353 df × -6.110178 3.518740 9.188105 ****** 3274.5147005097.347465 df × -6.105705 0.000000 0.000000 -0.000093 -0.002323 0.212201 df × -6.104350 -0.001534 6.106596 -0.009681 -0.020818 -0.157009 df × -6.102653 -0.010999 12.198122 ************************** df × 0.000000 3.525130 3.030176 -0.001297 0.000794 -0.030986 df × -0.013890 3.532817 9.190302 -2.899469 -15.664396 18.276776 df × 3.052853 5.287696 0.000000 -0.002905 -0.001726 0.212779 df × 3.049442 5.288942 6.110419 -0.012897 0.017083 -0.112793 df × 3.028614 5.286611 12.204695 **************************** df × 0.000000 -7.050261 3.030176 0.000965 -0.002559 -0.034354 df × 0.012700 -7.059874 9.200471 2227.1778562220.0114127228.953289 df × 9.158558 5.287696 0.000000 0.000255 -0.003515 0.207162 df × 9.158559 5.283807 6.108103 8.469077 0.356380 60.096674 df × 9.155817 5.252586 12.258239 *************************** ..................... ..................... Total Energy Binding E Time Iter Ef -9101.955019Ha -134.6437529Ha 75.2m 63 ** GEOMETRY OPTIMIZATION IN DELOCALIZED COORDINATES ** ** with FIXED COORDINATES ** Searching for a Minimum Input Coordinates (Angstroms) 下面就是原子坐標(biāo),坐標(biāo)顯示完后,dmol提示計(jì)算失敗,沒(méi)有任何提示語(yǔ)說(shuō)明那個(gè)地方可能出現(xiàn)問(wèn)題;一般是優(yōu)化幾步后出現(xiàn)問(wèn)題,失敗后在此基礎(chǔ)上再提交任務(wù)計(jì)算能成功! DERIVATIVES為什么有的計(jì)算不出來(lái)?是內(nèi)存問(wèn)題嗎?有遇到類似的情況的嗎?難道是最初的構(gòu)型不準(zhǔn)確,請(qǐng)高手回答,謝謝! [ Last edited by longchang on 2010-4-22 at 21:30 ] |
鐵蟲 (正式寫手)
| LZ看這個(gè)!GEOMETRY OPTIMIZATION IN DELOCALIZED COORDINATES ,沒(méi)猜錯(cuò)的話是你的坐標(biāo)問(wèn)題,應(yīng)該是你輸入的坐標(biāo)導(dǎo)致兩個(gè)原子的鍵長(zhǎng)超過(guò)MS默認(rèn)值了,建議檢查坐標(biāo),把Smearing設(shè)置大點(diǎn),,,再試試,研一,不是很懂,如有錯(cuò)誤還請(qǐng)諒解! |
木蟲 (著名寫手)
木蟲游民

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