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zhangguangping木蟲 (著名寫手)
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[資源]
【原創(chuàng)+分享】書寫金Au(111)面塊體電極的代碼
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閑來無事,自己構(gòu)建輸運(yùn)體系的時(shí)候電極不好生成塊狀的,因?yàn)槲覜]有使用過MS或者VNL,聽說這兩個(gè)軟件能夠?qū)崿F(xiàn)該功能。 自己寫了一個(gè)代碼來書寫Au(111)面塊狀電極的代碼,F(xiàn)在把它分享出來,看對蟲友們有沒有幫助。 現(xiàn)在我把使用的方法做一下說明: 1)所有書寫的電極平面都是垂直于z方向的。不管書寫左電極還是右電極,都是ABCABCABC的順序。 2)第一步,程序需要指定書寫的Au平面的最左邊(右電極)或者說最右邊(左電極)的那個(gè)Au平面的z坐標(biāo)。輸入正數(shù)表示要輸出右電極。負(fù)數(shù)表示要輸出左電極。 3)接下來要輸入nx,ny,nz三個(gè)整數(shù)(分三次輸入),nx,ny決定了Au平面的大小,nz決定了電極的層數(shù)。 下面以輸出一個(gè)第一平面的z坐標(biāo)是0.5的5*5*5的(右)電極的過程,界面如下: ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 這樣電極就做好了,輸出的結(jié)果可以直接用XcrySDen查看。真正使用的時(shí)候還是輸出一個(gè)大的電極,自己根據(jù)需要截取一個(gè)部分。 注:電極在xy方向上關(guān)于z對稱,所以nx,ny選擇合適,第一個(gè)平面上的中心原子會(huì)在z軸上。 下載地址:http://www.namipan.com/d/WRITE_A ... d425546a8e607df0100 另外請高手多批評(píng)指教。這只是弄著玩的東西,不很嚴(yán)謹(jǐn)。以后還是學(xué)習(xí)MS和VNL是正道。 [ Last edited by zhangguangping on 2010-5-10 at 12:24 ] 站在這兒回顧以前發(fā)的這個(gè)帖子,心理感慨萬千。 這就像自己變成老頭之后,回過頭來看自己小學(xué)時(shí)期寫的日記一樣。 非常感謝在我成長過程中給予幫助的老師和同學(xué)們。尤其是在第一性原理方面的校際好友們,他們的無私奉獻(xiàn)使得我較快的進(jìn)入這個(gè)領(lǐng)域。最后隆重感謝導(dǎo)師對我一貫的支持。 愿與小木蟲一同成長,與蟲友一起成長。 [ Last edited by zhangguangping on 2011-9-23 at 19:42 ] 附件里面是代碼和編譯好的可執(zhí)行文件。[ Last edited by zhangguangping on 2011-10-24 at 21:00 ] |
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木蟲 (著名寫手)
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