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zhanghuaiy銅蟲 (正式寫手)
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[交流]
【請教】最小二乘平面的問題 已有4人參與
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1，The chlorophenyl and hydroxyphenyl rings are each planar, the r.m.s. deviations from planarity for the two rings being 0.0012 and 0.0109 A , respectively. 2，The nitrone group formed by atoms C8, N8, C7 and C1 attached to two phenyl rings is nearly planar. Atoms N8, C8,C7 and C1 deviate from the least-squares plane by-0.008 (2), -0.013 (2), -0.017 (2) and -0.015 (2) A, respectivey. 這兩句話怎么翻譯? 第一句中的 r.m.s.怎么求算？-0.008 (2), -0.013 (2), -0.017 (2) and -0.015 (2) A數(shù)字又是怎么求算的？望各位大俠指點(diǎn)，不甚感謝�。�！ |
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2樓2010-05-18 16:06:41
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在ins文件里輸入MPLA n A1 A2 A3..... n 是 你想要建立平面的原子個數(shù)，后面A1到An是原子名字。 比如說 你的C8，N8， C7，C1 MPLA 4 C8 N8 C7 C1 就可以了，shelxtl會給出這四個原子組成的平面還會給出這四個原子到該平面的距離。結(jié)果到LST文件里找。 如果你輸入MPLA 3 C8 N8 C7 C1 那么shelxtl就是用C8 N8 C7 這三個原子建立平面，然后計算著四個原子到該平面的距離。 如果你輸入 MPLA n1 A1 A2... MPLA n2 B1 B2... shelxtl除了給出這些距離外還會自動計算這兩個平面的夾角。 結(jié)果在LST文件里。 我之前上傳過一個ppt有關(guān)XRD解析和原理的應(yīng)該對你有用 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1958392&fpage=1 [ Last edited by cluster8676 on 2010-5-19 at 00:10 ] |
3樓2010-05-19 00:03:03
4樓2010-05-19 00:14:34
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5樓2010-05-19 00:14:54
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Least-squares planes (x,y,z in crystal coordinates) and deviations from them (* indicates atom used to define plane) 2.3443 (0.0044) x + 7.4105 (0.0042) y - 0.0155 (0.0053) z = 1.9777 (0.0044) * -0.0743 (0.0008) C7 * 0.0684 (0.0008) C11 * -0.0418 (0.0009) C8 * -0.0062 (0.0008) C4 * 0.0538 (0.0008) O3 -0.0061 (0.0020) O1 -0.0980 (0.0028) N6 -0.0562 (0.0023) C9 -0.0314 (0.0030) C10 Rms deviation of fitted atoms = 0.0546 2.5438 (0.0040) x + 7.3488 (0.0040) y - 0.1657 (0.0042) z = 1.8626 (0.0026) Angle to previous plane (with approximate esd) = 2.45 ( 0.07 ) * 0.0054 (0.0008) C10 * 0.0082 (0.0008) N6 * -0.0052 (0.0012) C9 * -0.0337 (0.0012) C8 * 0.0135 (0.0008) C11 * 0.0118 (0.0009) C4 0.0568 (0.0019) O1 0.0214 (0.0018) O3 -0.1542 (0.0020) C7 Rms deviation of fitted atoms = 0.0162 |
6樓2010-05-19 00:31:01
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這里就說明了怎樣去讀取lst文件 本來想翻譯呢，結(jié)果cluster8676已經(jīng)弄好了。就給您說說后面的內(nèi)容 lst文件給出了相應(yīng)的數(shù)據(jù)結(jié)果 * -0.0743 (0.0008) C7 * 0.0684 (0.0008) C11 * -0.0418 (0.0009) C8 * -0.0062 (0.0008) C4 * 0.0538 (0.0008) O3 -0.0061 (0.0020) O1 -0.0980 (0.0028) N6 -0.0562 (0.0023) C9 -0.0314 (0.0030) C10 中列出了構(gòu)成一個平面的原子，及相對于最小而成平面的偏差 列在原子序號前面。但是列出這么一堆數(shù)據(jù)不足以說明到底這個平面性如何，那么就可用均方根偏差（r.m.s. deviation）來表示。您的第一個問題中的那兩個數(shù)值就是這么來的。在我局舉的這個例子中，由那些原子組成的平面方程是2.3443 (0.0044) x + 7.4105 (0.0042) y - 0.0155 (0.0053) z = 1.9777 (0.0044)，均方根偏差Rms deviation of fitted atoms = 0.0546。 當(dāng)然例子中還給出了第二個平面的信息 2.5438 (0.0040) x + 7.3488 (0.0040) y - 0.1657 (0.0042) z = 1.8626 (0.0026) Angle to previous plane (with approximate esd) = 2.45 ( 0.07 ) * 0.0054 (0.0008) C10 * 0.0082 (0.0008) N6 * -0.0052 (0.0012) C9 * -0.0337 (0.0012) C8 * 0.0135 (0.0008) C11 * 0.0118 (0.0009) C4 0.0568 (0.0019) O1 0.0214 (0.0018) O3 -0.1542 (0.0020) C7 Rms deviation of fitted atoms = 0.0162 Angle to previous plane (with approximate esd) = 2.45 ( 0.07 )這句話還告訴我們這個平面與前面的平面是有夾角的2.45（7）度。其他信息是一樣的。 另外說明一句，這個例子來自shelx97 的說明書。希望大家還是先去看說明書。 |
7樓2010-05-19 00:39:52
zhanghuaiy
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8樓2010-05-19 11:06:47
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9樓2010-05-19 11:57:44
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