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bhcsmay金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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【求助】哪位大俠用過(guò)onetep優(yōu)化結(jié)構(gòu)？ 已有3人參與
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我建立了一個(gè)半導(dǎo)體氧化物薄膜，該晶胞大約有300個(gè)原子，服務(wù)器足夠大，用onetep模塊優(yōu)化將近十二個(gè)小時(shí)status至今一步也沒(méi)有跳出來(lái)，請(qǐng)問(wèn)可能是什么原因呢？我們實(shí)驗(yàn)室以前有人也做過(guò)類(lèi)似的試驗(yàn)，但是都是onetep優(yōu)化晶胞沒(méi)有成功，但是計(jì)算能量計(jì)算體系及速度都驚人...... [ Last edited by bhcsmay on 2010-5-21 at 08:48 ] |
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2樓2010-05-21 14:32:59
3樓2010-05-21 14:37:38
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4樓2010-05-21 14:44:58
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5樓2010-05-21 17:46:19
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6樓2010-05-21 18:58:11
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bhcsmay(金幣+2):謝謝耐心回復(fù)！ 2010-05-21 20:11:03
gavinliu7390(金幣+2):謝謝解答！ 2010-05-21 20:17:45
bhcsmay(金幣+2):謝謝耐心回復(fù)！ 2010-05-21 20:11:03
gavinliu7390(金幣+2):謝謝解答！ 2010-05-21 20:17:45
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確實(shí)沒(méi)咋用過(guò)onetep 現(xiàn)在的情況是：12個(gè)小時(shí)的計(jì)算之后幾何優(yōu)化沒(méi)有走一步（即scf迭代完成一次收斂），還是說(shuō)連一步簡(jiǎn)單scf計(jì)算也沒(méi)有走？ 如果只是優(yōu)化的沒(méi)有完成還有可能是參數(shù)設(shè)置的問(wèn)題；如果這么長(zhǎng)時(shí)間內(nèi)一直在計(jì)算，卻連一個(gè)scf步驟也沒(méi)有完成，那說(shuō)明這個(gè)計(jì)算量確實(shí)是太大。 但樓主說(shuō)dmol都可以?xún)?yōu)化，難道是onetep比dmol慢？以前曾經(jīng)試驗(yàn)過(guò)，對(duì)于小體系的計(jì)算，確實(shí)onetep比dmol要慢很多，但考慮到它特點(diǎn)是計(jì)算量隨著模型大小是O(N)增加的，我當(dāng)時(shí)還以為對(duì)于大體系onetep的速度會(huì)超過(guò)dmol。沒(méi)想到在300個(gè)原子的時(shí)候仍是dmol快？若是這樣，考慮到onetep所能計(jì)算的性質(zhì)又很少，意義不大啊。 一直覺(jué)得現(xiàn)在的onetep模塊就是個(gè)半成品，希望以后的版本能提升吧。  |
7樓2010-05-21 19:51:38
bhcsmay
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嗯，scf計(jì)算也沒(méi)有走，dmol確實(shí)是可以算的，但是太慢了，所以我想到先用onetep優(yōu)化一下結(jié)構(gòu)，可結(jié)果就是這樣，我現(xiàn)在的猜測(cè)也是體系不夠大，onetep的優(yōu)點(diǎn)體現(xiàn)不出來(lái)，但是再大的體系回頭計(jì)算性質(zhì)又有問(wèn)題了，onetep大部分性質(zhì)計(jì)算不了，超過(guò)300個(gè)原子dmol也無(wú)法計(jì)算了，那么我優(yōu)化了也沒(méi)有多大意義，唉，這個(gè)模塊看來(lái)就是個(gè)雞肋呀...... |
8樓2010-05-21 20:10:45
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9樓2012-04-25 16:05:51
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