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wudi_82

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[交流] 【求助】安裝MPI 【已解決】已有3人參與

請(qǐng)問哪位有安裝MPI的詳細(xì)過程？我自己在網(wǎng)上找了幾個(gè)，試著安裝總失敗。MPI指導(dǎo)手冊(cè)里提到需要很多的庫函數(shù)包，但我聽人說這其中很多庫函數(shù)也不是必須的，因此也沒有安裝指導(dǎo)手冊(cè)上的說明裝。
MPI-1.2就可以， MPI-2 有點(diǎn)復(fù)雜。
謝謝了。

[ Last edited by wudi_82 on 2010-6-3 at 12:10 ]

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1樓 2010-06-01 18:33:37

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wudi_82(金幣+1):感謝提醒。 2010-06-02 22:07:13

windows? or Linux? or other?

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2樓2010-06-01 22:21:40

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這個(gè)不是很懂。我只知道聯(lián)并行機(jī)的時(shí)候用這個(gè)……

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3樓2010-06-02 10:23:21

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wudi_82

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Sorry, 我忘記提了。我需要在Linux系統(tǒng)下使用

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4樓2010-06-02 22:06:09

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★ ★ ★
javeey(金幣+3):謝謝提供幫助 2010-06-02 23:58:56
Doctorcbw(數(shù)學(xué)EPI+1): 2010-06-03 08:40:46
wudi_82(金幣+4):感謝你相信的說明！ 2010-06-03 12:04:01

下面簡要說一些注意事項(xiàng)：

1、編譯器
2、rsh配置
3、mpich1.*的安裝
這些說明主要來源于我的blog。有的地方變成表情，沒關(guān)系。

硬件配置：

主板：升技KN9-S
CPU：AMD3800+
內(nèi)存：KST 1G DDR533  *  2
顯卡：藍(lán)X550企業(yè)靜音
機(jī)箱：ATX+鑫谷300W
網(wǎng)卡：主板集成網(wǎng)卡
交換機(jī)：思科WS-12960-48TT
操作系統(tǒng)：RHEL4.U4.X86_64（支持串口硬盤）

在安裝OS的時(shí)候，注意選擇老的服務(wù)器***，開發(fā)***類的，把rsh，glibc等安裝了。

配置rsh信任服務(wù)器用

在所有機(jī)器里面進(jìn)行以下三個(gè)文件編輯
[xiaogouzi@node01 ~]$ vi .rhosts
node01
node02
...
[root@node01 tfbao]# vi /etc/hosts

# Do not remove the following line, or various programs
# that require network functionality will fail.
127.0.0.1             node01.cfd node01 localhost.localdomain localhost
               （注意，這里不同的機(jī)器名）
192.168.211.101       node01.cfd node01
192.168.211.102       node02.cfd node02
...
[root@node01 tfbao]# vi /etc/hosts.equiv
node01.cfd xiaogouzi
node02.cfd xiaogouzi
...
啟動(dòng)rsh，rlogin等r服務(wù)，現(xiàn)在基本上實(shí)現(xiàn)rsh服務(wù)，例如：
[xiaogouzi@node01 ~]$ rsh node16
Last login: Sun Sep  3 15:57:47 from node01
[xiaogouzi@node16 ~]$

編譯器的安裝

編譯器一般用PGI，這個(gè)天狼上有盜版的其裝法各個(gè)版本略有不同。我們使用PGI.Server.v6.0.5.LINUX-TBE，下面列出方法：

先以root修改下列文件，目的是設(shè)置壞境變量，我們這里是將其安裝在/usr/pgi里面的，如果裝在別的地方，作適當(dāng)修改。最后一句的意義是改變編碼，以便能夠較好的顯示漢語等。

# /etc/profile
# System wide environment and startup programs, for login setup
# Functions and aliases go in /etc/bashrc

pathmunge () {
      if ! echo $PATH | /bin/egrep -q "(^|

$1($|

" ; then
         if [ "$2" = "after" ] ; then
            PATH=$PATH:$1
         else
         PATH=$1:$PATH
         fi
      fi
}
# Path manipulation
if [ `id -u` = 0 ]; then
      pathmunge /sbin
      pathmunge /usr/sbin
      pathmunge /usr/local/sbin
fi
pathmunge /usr/X11R6/bin after
# No core files by default
ulimit -S -c 0 > /dev/null 2>&1
USER="`id -un`"
LOGNAME=$USER
MAIL="/var/spool/mail/$USER"
HOSTNAME=`/bin/hostname`
HISTSIZE=1000
if [ -z "$INPUTRC" -a ! -f "$HOME/.inputrc" ]; then
INPUTRC=/etc/inputrc
fi
export PATH USER LOGNAME MAIL HOSTNAME HISTSIZE INPUTRC
for i in /etc/profile.d/*.sh ; do
if [ -r "$i" ]; then
      . $i
fi
done
unset i
unset pathmunge
PGI=/usr/pgi
export PGI
PATH=$PGI/linux86-64/6.0/bin:$PATH
export PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/pgi/linux86-64/6.0/lib
MANPATH=$MANPATH:$PGI/man
export MANPATH
export LM_LICENSE_FILE=$PGI/license.dat
export MPICH=/usr/mpich
export PATH=$MPICH/bin:$PATH
export LC_ALL=zh_CN.GB2312
編輯完了，退出重新登錄即可。然后進(jìn)入安裝pgi，正常安裝即可，如果出現(xiàn)找不到文件，則解壓內(nèi)部相關(guān)包，即可。然后將PGI.Server.v6.0.5.LINUX-TBE下的license.dat coppy到/usr/pgi下復(fù)蓋之。

mpi的安裝
解壓好軟件之后，假定我們的安裝目錄為/usr/mpich
./configure –enable-debug –prefix=/usr/mpich \
>-fc=pgf77 –f90=pgf90 –rsh=rsh

Make && make install

# Vi /usr/mpich/share/machines.LINUX

內(nèi)容如下：
node01
node02
......

改用普通用戶，用example里面的例子測(cè)試一下即可。

[ Last edited by onesupeng on 2010-6-2 at 22:31 ]

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5樓2010-06-02 22:29:59

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看起來版上作并行的不多嘛

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6樓2010-06-03 10:34:06

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我也不是專門搞并行的，我是搞間斷有限元的。計(jì)算三維問題時(shí)，串行程序的等待時(shí)間難以忍受。

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7樓2010-06-03 12:06:10

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★
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流

都算什么問題？

引用回帖:

Originally posted by wudi_82 at 2010-06-03 12:06:10:
我也不是專門搞并行的，我是搞間斷有限元的。計(jì)算三維問題時(shí)，串行程序的等待時(shí)間難以忍受。

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8樓2010-06-03 13:35:37

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