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hijing金蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
【求助】關(guān)于autodock對(duì)接結(jié)果的問(wèn)題 已有2人參與
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本人用Autodock對(duì)接，結(jié)果分析時(shí)發(fā)現(xiàn)配體小分子的一些鍵斷了，分子被拆散了，氫原子也沒(méi)了。這是怎么回事？有什么解決方法嗎？另我的小分子是用Hyperchem優(yōu)化的，有關(guān)聯(lián)嗎？望大家多多指教啊， |
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2樓2010-06-03 21:30:26
hijing
金蟲(chóng) (小有名氣)
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3樓2010-06-04 08:51:19
宸雨沐沐
新蟲(chóng) (初入文壇)
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4樓2016-04-25 10:46:50
5樓2016-05-07 10:26:13
zfb601
金蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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★
小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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樓主我用vina對(duì)接的時(shí)候也出了這個(gè)問(wèn)題，請(qǐng)問(wèn)樓主你是不是用sybyl進(jìn)行結(jié)果分析的？ 還有一個(gè)問(wèn)題是對(duì)接結(jié)果中碳原子用pymol顯示的話標(biāo)色可能會(huì)不一樣。 個(gè)人推測(cè)是因?yàn)閍utodock對(duì)接結(jié)果文件中原子類(lèi)型和其他軟件不兼容的原因，但是不知該如何設(shè)置。有機(jī)會(huì)可以共同探討探討  另，我用了很多的優(yōu)化方法，但是并無(wú)卵用。。。。 感覺(jué)就是ADT在對(duì)接的時(shí)候修改了原子類(lèi)型。。。 |
6樓2016-05-10 21:59:24
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