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zhangguangping

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mazuju028(金幣+2):謝謝交流 2010-12-05 12:46:30

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Originally posted by redskywei at 2010-06-08 14:23:46:
如題，我在用transesta計算輸運時發(fā)現(xiàn)，最后收斂的的時候，這些值都比較大，他就停止迭代了：
TranSiesta: Qsol,Qtot: 515.152 512.000 1.000
transiesta: 290 -19912.8627 -19914.3989 -19914.3989 ...

假如你設(shè)置的最大收斂步數(shù)是300，如果在生成*DM的時候就用了100步，那么剩下的transiesta部分就只有200步的容量了。只要這個部分超過200步就不再自洽了。為了避免這個問題，可以將最大收斂步數(shù)設(shè)置的大一點。至于你說的收斂慢的問題，你可以通過調(diào)節(jié)參數(shù)加快收斂。比如減小mixing的大小，到0.01甚至更小0.001。另外升高溫度也是一個辦法。還有就是你可以減小電壓的間隔等等。

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弘德明志博學(xué)篤行

11樓2010-12-05 09:03:16

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引用回帖:

Originally posted by zhangguangping at 2010-12-05 09:03:16:

假如你設(shè)置的最大收斂步數(shù)是300，如果在生成*DM的時候就用了100步，那么剩下的transiesta部分就只有200步的容量了。只要這個部分超過200步就不再自洽了。為了避免這個問題，可以將最大收斂步數(shù)設(shè)置的大一點。至 ...

我設(shè)置的都是500步以上，而且如果結(jié)構(gòu)或者參數(shù)合理都應(yīng)該在100步內(nèi)收斂的，幾百步后收斂的結(jié)果感覺合理性也太低了。我不能確定倒是是結(jié)構(gòu)問題還是參數(shù)問題。相關(guān)的參數(shù)都做過調(diào)試，可是效果甚微，這一陣子忙，都沒做這個調(diào)試了，謝謝你的熱情建議。

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12樓2010-12-05 11:42:56

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1143366樓: Originally posted by zhangguangping at 2010-12-05 09:03:16
假如你設(shè)置的最大收斂步數(shù)是300，如果在生成*DM的時候就用了100步，那么剩下的transiesta部分就只有200步的容量了。只要這個部分超過200步就不再自洽了。為了避免這個問題，可以將最大收斂步數(shù)設(shè)置的大一點。至于 ...

請教一下，我設(shè)置的最大收斂步數(shù)是300，在生成DM的時候用了80步，transiesta部分用了219步，最后幾步是這樣的：
TranSiesta: Qsol,Qtot:  642.949  648.000 1.000
transiesta: 215 -26765.1344 -26747.3661 -26747.3661  2.1550 -4.2916
TranSiesta: Qsol,Qtot:  643.029  648.000 1.000
transiesta: 216 -26765.6436 -26746.9487 -26746.9487  2.1597 -4.2916
TranSiesta: Qsol,Qtot:  643.236  648.000 1.000
transiesta: 217 -26761.5195 -26749.6322 -26749.6322  2.5464 -4.2916
TranSiesta: Qsol,Qtot:  645.472  648.000 1.000
transiesta: 218 -26806.0344 -26744.7761 -26744.7761  4.9645 -4.2916
TranSiesta: Qsol,Qtot:  642.600  648.000 1.000
transiesta: 219 -26762.4977 -26747.7480 -26747.7480  2.9842 -4.2916
看樣子是沒達(dá)到收斂，可是我的文件夾里卻生成了*.TSHS和*.TSDE這兩個文件。暈了，不知道究竟收斂沒有，算完了沒有啊？能否麻煩guangping兄百忙中幫忙看看？萬分感激！

再補充一下，我的輸入文件名是Si3N4-2L-scat-1.fdf，但是得到的卻是名為Si3N4-2L-scat.TSDE和Si3N4-2L-scat.TSHS的兩個文件，奇怪它們的前面部分不是應(yīng)該和輸入文件的前面部分一樣嗎？這樣算不算正確��？

[ Last edited by xiongxiong5712 on 2012-11-17 at 17:40 ]

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13樓2012-11-17 17:35:21

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1184366樓: Originally posted by xiongxiong5712 at 2012-11-17 17:35:21
請教一下，我設(shè)置的最大收斂步數(shù)是300，在生成DM的時候用了80步，transiesta部分用了219步，最后幾步是這樣的：
TranSiesta: Qsol,Qtot: 642.949 648.000 1.000
transiesta: 215 -26765.1344 -267 ...

沒有收斂。超出了你的最大自洽步數(shù)。自洽在有SIESTA的時候，也算在內(nèi)。299步，最后一步?jīng)]有給出來。但是TSHS是生成的。TSDE只要做TranSIESTA自洽就生成。

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弘德明志博學(xué)篤行

14樓2012-11-17 17:42:59

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1184367樓: Originally posted by zhangguangping at 2012-11-17 17:42:59
沒有收斂。超出了你的最大自洽步數(shù)。自洽在有SIESTA的時候，也算在內(nèi)。299步，最后一步?jīng)]有給出來。但是TSHS是生成的。TSDE只要做TranSIESTA自洽就生成。...

哦，謝謝哈，剛開始還以為收斂了呢，白激動了，呵呵。我在我的輸入文件里看到這樣的參數(shù)：
TS.TBT.PDOSFrom 5
TS.TBT.PDOSTo 5
TS.TBT.CalcIeig yes
這幾個參數(shù)我在手冊上沒有看到過，是從別人的輸入文件里面拷貝過來的。網(wǎng)上查了也沒找到，請問它們是什么意思��？不知道這幾個參數(shù)對計算有沒有影響，我現(xiàn)在把它們刪去了再重新計算試試。

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15樓2012-11-17 17:55:12

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1184369樓: Originally posted by xiongxiong5712 at 2012-11-17 17:55:12
哦，謝謝哈，剛開始還以為收斂了呢，白激動了，呵呵。我在我的輸入文件里看到這樣的參數(shù)：
TS.TBT.PDOSFrom 5
TS.TBT.PDOSTo 5
TS.TBT.CalcIeig yes
這幾個參數(shù)我在手冊上沒有看到過，是從別人的輸入文 ...

這個參數(shù)在新版中有解釋。你官網(wǎng)上下載新版本看看手冊。

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弘德明志博學(xué)篤行

16樓2012-11-17 18:29:28

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1184370樓: Originally posted by zhangguangping at 2012-11-17 18:29:28
這個參數(shù)在新版中有解釋。你官網(wǎng)上下載新版本看看手冊。...

好的，多謝指點

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17樓2012-11-17 18:37:12

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486194樓: Originally posted by zhangguangping at 2010-06-09 14:20:39
你這個都迭代291次了，是不是你設(shè)置的最大迭代次數(shù)是300，其中在transiesta開始的siesta計算中用了9個迭代。所以說你現(xiàn)在超出了迭代的設(shè)置。如果不超的話，它的收斂標(biāo)準(zhǔn)是DM.Tolerance所設(shè)置的，顯然你現(xiàn)在是0.40 ...

請問transiesta的收斂標(biāo)準(zhǔn)只需要看transiesta自洽的最后一步DM.Tolerance是否小于0.0001就行了嗎？我計算出來transiesta自洽最后幾步是這樣的：
transiesta:  48 50769.9893 50769.5516 50769.5516  0.0003 -4.2916
TranSiesta: Qsol,Qtot:  329.637  648.000 1.000
transiesta:  49 50769.9270 50770.7288 50770.7288  0.0002 -4.2916
TranSiesta: Qsol,Qtot:  329.637  648.000 1.000
transiesta:  50 50769.9278 50770.7760 50770.7760  0.0002 -4.2916
TranSiesta: Qsol,Qtot:  329.637  648.000 1.000
transiesta:  51 50769.9540 50770.2319 50770.2319  0.0001 -4.2916

siesta: E_KS(eV) =          50770.2319

siesta: E_KS - E_eggbox =    50770.2319

siesta: Atomic forces (eV/Ang):
----------------------------------------
Tot 0.059440 -0.009480 -0.017760
----------------------------------------
Max  656.743364
Res  216.569188 sqrt( Sum f_i^2 / 3N )
----------------------------------------
Max  656.743364 constrained

在第51步的時候收斂了，但是后面Max  656.743364怎么這么大，這樣算收斂了嗎？這里Max是不是也需要收斂，也就是小于0.04才行啊？

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18樓2012-11-27 08:25:37

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1184624樓: Originally posted by xiongxiong5712 at 2012-11-27 08:25:37
請問transiesta的收斂標(biāo)準(zhǔn)只需要看transiesta自洽的最后一步DM.Tolerance是否小于0.0001就行了嗎？我計算出來transiesta自洽最后幾步是這樣的：
transiesta: 48 50769.9893 50769.5516 50769.5516 0.0 ...

Max指的是原子受力吧？在非平衡輸運體系中，原子力的計算，現(xiàn)在SIESTA還不能給出正確的結(jié)果。并且我們使用當(dāng)下的TranSIESTA默認(rèn)就是做了一個近似，認(rèn)為偏壓下體系結(jié)構(gòu)近似不變。所以體系在偏壓下結(jié)果變化很大的情況，現(xiàn)在不能自洽研究。

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19樓2012-11-27 10:34:00

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1184628樓: Originally posted by zhangguangping at 2012-11-27 10:34:00
Max指的是原子受力吧？在非平衡輸運體系中，原子力的計算，現(xiàn)在SIESTA還不能給出正確的結(jié)果。并且我們使用當(dāng)下的TranSIESTA默認(rèn)就是做了一個近似，認(rèn)為偏壓下體系結(jié)構(gòu)近似不變。所以體系在偏壓下結(jié)果變化很大的情況 ...

我是在零壓下算的，沒加偏壓。不能自洽研究是什么意思？是說我這個體系有問題，導(dǎo)致不能收斂嗎？

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20樓2012-11-27 10:44:36

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