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redskywei木蟲 (著名寫手)
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[交流]
【求助】siesta中transiesta模塊的收斂標(biāo)準(zhǔn)是啥~~ 已有4人參與
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如題，我在用transesta計算輸運時發(fā)現(xiàn)，最后收斂的的時候，這些值都比較大，他就停止迭代了： TranSiesta: Qsol,Qtot: 515.152 512.000 1.000 transiesta: 290 -19912.8627 -19914.3989 -19914.3989 0.4114 -5.3182 TranSiesta: Qsol,Qtot: 514.839 512.000 1.000 transiesta: 291 -19908.1417 -19913.3302 -19913.3302 0.4050 -5.3182 那么到底他判斷收斂是什么標(biāo)準(zhǔn)呢~~~ 另外，俺們的收斂特別慢，除了跟參數(shù)有關(guān)外，還跟什么東西有關(guān)？ 這里面的這些量都是些啥？ |
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zhangguangping
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redskywei(金幣+5):多謝指點，可是siesta這么快收斂，transiesta這么這么難的收斂~~~ 2010-06-09 14:23:35
zzy870720z(金幣+1):謝謝指點 2010-06-09 15:14:21
redskywei(金幣+5):多謝指點，可是siesta這么快收斂，transiesta這么這么難的收斂~~~ 2010-06-09 14:23:35
zzy870720z(金幣+1):謝謝指點 2010-06-09 15:14:21
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你這個都迭代291次了，是不是你設(shè)置的最大迭代次數(shù)是300，其中在transiesta開始的siesta計算中用了9個迭代。所以說你現(xiàn)在超出了迭代的設(shè)置。如果不超的話，它的收斂標(biāo)準(zhǔn)是DM.Tolerance所設(shè)置的，顯然你現(xiàn)在是0.4050，估計沒有達(dá)到你設(shè)置的標(biāo)準(zhǔn)。一般都設(shè)置為1.0d-4或者是1.0d-3 |
2樓2010-06-09 14:20:39
zhangguangping
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zzy870720z(金幣+1):謝謝補(bǔ)充，呵呵 2010-06-09 15:14:31
redskywei(金幣+5):多謝交流，讓我對參數(shù)理解更清楚了~~ 2010-06-09 23:08:06
zzy870720z(金幣+1):謝謝補(bǔ)充，呵呵 2010-06-09 15:14:31
redskywei(金幣+5):多謝交流，讓我對參數(shù)理解更清楚了~~ 2010-06-09 23:08:06
| transiesta難收斂的情況也不好說！我也遇到一次。那次是我選取的緩沖層有點少。緩沖層不但起到屏蔽作用，還有助于加快收斂。所以你可以試試把擴(kuò)展分子兩邊的電極部分取得多一點�；蛘哂袀�選項你設(shè)置一下也可以起作用的。TS.UpdateDMCROnly F.我自己認(rèn)為如果這個選項設(shè)置為T就表示在進(jìn)行Transiesta迭代計算的時候密度矩陣只是更新擴(kuò)展分子中間散射區(qū)的，不更新屬于電極的那些原子。要是設(shè)置這個為F，那么整個擴(kuò)展分子的密度矩陣在迭代過程中都要更新。要是這個設(shè)置為F之后收斂好了，我認(rèn)為緩沖區(qū)選取的有點少！所以應(yīng)該加大這個緩沖區(qū)。這個緊緊是我自己的理解！一般自由分子距離電極中間要有4-5層的金屬原子，這個緩沖一般情況足夠了。但是為了計算的需要（減少計算時間），不是選的這么多！所以這個問題遇到的就多一些！ |
3樓2010-06-09 14:35:09
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4樓2010-06-09 16:02:51
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5樓2010-06-09 23:09:32
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zzy870720z(金幣+1):感謝交流 2010-06-10 12:09:32
redskywei(金幣+5):多謝指點，我嘗試過你提到的DM.MixingWeight參數(shù)，不過效果不好，但是DM.NumberPulay我最大也就設(shè)置10 2010-06-12 15:54:07
zzy870720z(金幣+1):感謝交流 2010-06-10 12:09:32
redskywei(金幣+5):多謝指點，我嘗試過你提到的DM.MixingWeight參數(shù)，不過效果不好，但是DM.NumberPulay我最大也就設(shè)置10 2010-06-12 15:54:07
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咱們都只是相當(dāng)于作單點計算，收斂快慢，我想應(yīng)該和你設(shè)置的參數(shù)有關(guān)。 你設(shè)置的DM.MixingWeight 是多少？可以設(shè)置小點的比如 0.01。而DM.NumberPulay設(shè)置大些，8,10,20,40這些可以試試。一般情況20應(yīng)該是足夠了。我一般先設(shè)置在8左右。 |
6樓2010-06-10 09:36:40
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redskywei(金幣+4):多謝交流，對TS.ComplexContour.Emin我倒是沒注意過～～ 2010-06-17 13:33:11
zzy870720z(金幣+1):謝謝交流 2010-06-20 13:22:15
redskywei(金幣+4):多謝交流，對TS.ComplexContour.Emin我倒是沒注意過～～ 2010-06-17 13:33:11
zzy870720z(金幣+1):謝謝交流 2010-06-20 13:22:15
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改變DM.MixingWeight參數(shù)，對于siesta計算收斂很好，值越小收斂的速度越慢。對于金屬性的一般值要小，特別是能隙比較小的體系。但對于transiesta我也不是很清楚要調(diào)什么參數(shù)�，F(xiàn)在也在摸索階段。如果在有電壓下，我想TS.BiasContour.NumPoints這個參數(shù)很重要�？梢栽囋囘@個，并且可以把TS.ComplexContour.Emin降點。雖然你設(shè)的值已經(jīng)是低于最小值了，有時在有電壓下，情況會有變化，再降一點有時候有作用。 |
7樓2010-06-12 17:36:44
zhangguangping
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8樓2010-06-19 21:49:32
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9樓2010-06-20 21:00:18
zhangguangping
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10樓2010-12-04 11:17:02
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