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maoxiaoming銅蟲 (初入文壇)
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[交流]
【求助】環(huán)糊精包合物的分子模擬 已有13人參與
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我前段時(shí)間做了一些環(huán)糊精包合物方面的研究,對(duì)包合物進(jìn)行了一些表征,但所做的分析討論太過淺顯。 想試著做些分子模擬方面的探討。但在分子模擬方面什么也不懂。 想請(qǐng)問一下:一般做包合物的分子模擬用什么軟件比較好? 有沒有相關(guān)的文獻(xiàn)資料推薦?因?yàn)檫@方面的軟件一點(diǎn)都不會(huì)。 對(duì)電腦的配置有些什么要求? 謝謝!謝謝!謝謝! [ Last edited by maoxiaoming on 2010-6-10 at 13:18 ] |
銀蟲 (小有名氣)
新蟲 (小有名氣)
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作為一個(gè)過來人,說兩句話。 我也做實(shí)驗(yàn)和模擬。不知道你要做到什么程度,從時(shí)間上看,我建議你暫時(shí)不要去碰gromacs和namd,學(xué)習(xí)Material Studio/DS比較適合你,原因有二: 1)這兩個(gè)專用于模擬,是計(jì)算專業(yè)戶吃飯的家伙。需要一定時(shí)間掌握,對(duì)體系要有很好的了解,不是一切默認(rèn)能搞定問題的。這兩者都只是MD代碼,對(duì)于標(biāo)準(zhǔn)立場未參數(shù)化的化合物一樣無能為力,參數(shù)化一套東西,花個(gè)1年很正常,特別要是分子大一點(diǎn)。如果走這條路,你要準(zhǔn)備至少2年空白時(shí)間(!。。。。不知道你有沒有 2)MS/DS是鼠標(biāo)操作,比較傻。。。一般實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)配套簡單的電子結(jié)構(gòu),能級(jí)或者簡單的MD,熱力學(xué)量分析(這些現(xiàn)在版本的MS/DS都能做),足矣~ 僅供參考 |
禁言 (初入文壇)
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