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【求助】關(guān)于shelx加氫的問題 已有5人參與
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在精修的最后我對(duì)NH3中的N進(jìn)行加氫，用HFIX 33， 但是最后出來有兩個(gè)N上的氫變成了如下圖那樣的3對(duì)。誰知道是怎么回事嗎？ |
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wsht212(金幣+1):謝謝LZ交流 2010-06-13 23:29:54
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大家?guī)臀铱匆幌聄es文件，我不知道哪里要改。。。謝謝了！ TITL jzjun10a in Pnma CELL 0.71073 13.2903 7.5220 15.0990 90.000 90.000 90.000 ZERR 4.00 0.0027 0.0015 0.0030 0.000 0.000 0.000 LATT 1 SYMM 0.5-X, -Y, 0.5+Z SYMM -X, 0.5+Y, -Z SYMM 0.5+X, 0.5-Y, 0.5-Z SFAC N H GA I UNIT 28 84 4 12 L.S. 4 BOND FMAP 2 PLAN 20 TEMP -170 LIST 3 WGHT 0.100000 FVAR 0.17769 I1 4 0.386071 0.250000 0.452813 10.50000 0.01200 0.01287 = 0.01268 0.00000 -0.00027 0.00000 I2 4 0.061739 0.250000 0.362806 10.50000 0.01283 0.01714 = 0.01447 0.00000 0.00211 0.00000 I3 4 0.164740 0.250000 -0.263670 10.50000 0.02258 0.01410 = 0.01323 0.00000 0.00029 0.00000 GA4 3 0.226306 0.250000 0.097217 10.50000 0.00988 0.00931 = 0.00810 0.00000 0.00072 0.00000 N1 1 0.298827 0.250000 0.219022 10.50000 0.01645 0.01475 = 0.00927 0.00000 -0.00287 0.00000 AFIX 33 H1A 2 0.268844 0.330358 0.255534 11.00000 -1.50000 H1B 2 0.364598 0.279921 0.211363 11.00000 -1.50000 H1C 2 0.294824 0.139720 0.243550 11.00000 -1.50000 AFIX 0 N2 1 0.321023 0.056802 0.047131 11.00000 0.01587 0.01676 = 0.01844 -0.00513 -0.00095 0.00063 AFIX 33 H2A 2 0.296012 -0.052637 0.060371 11.00000 -1.50000 H2B 2 0.383185 0.068988 0.071660 11.00000 -1.50000 H2C 2 0.325590 0.068958 -0.012698 11.00000 -1.50000 AFIX 0 N3 1 0.130646 0.052676 0.146440 11.00000 0.01541 0.02347 = 0.00708 -0.00069 0.00268 0.00045 AFIX 33 H3A 2 0.077501 0.104380 0.174380 11.00000 -1.50000 H3B 2 0.164924 -0.016744 0.185503 11.00000 -1.50000 H3C 2 0.107879 -0.015489 0.100859 11.00000 -1.50000 AFIX 0 N4 1 0.147955 0.250000 -0.022404 10.50000 0.01842 0.01951 = 0.01010 0.00000 -0.00150 0.00000 AFIX 33 H4A 2 0.096861 0.330346 -0.019664 11.00000 -1.50000 H4B 2 0.122285 0.139716 -0.032566 11.00000 -1.50000 H4C 2 0.190521 0.279938 -0.067194 11.00000 -1.50000 AFIX 0 N5 1 0.098908 -0.250000 0.379726 10.50000 0.02773 0.02662 = 0.02262 0.00000 -0.01804 0.00000 HKLF 4 REM jzjun10a in Pnma REM R1 = 0.0518 for 1782 Fo > 4sig(Fo) and 0.0616 for all 1987 data REM 61 parameters refined using 0 restraints END WGHT 0.0359 36.3504 REM Highest difference peak 1.592, deepest hole -1.672, 1-sigma level 0.307 Q1 1 0.2978 0.2500 -0.2167 10.50000 0.05 1.59 Q2 1 0.3048 -0.2500 0.1212 10.50000 0.05 1.17 Q3 1 0.2872 0.2500 0.2697 10.50000 0.05 1.15 Q4 1 0.0343 0.2500 0.0877 10.50000 0.05 1.14 Q5 1 0.2618 0.2500 0.4226 10.50000 0.05 1.09 Q6 1 -0.0051 0.2500 0.4500 10.50000 0.05 1.02 Q7 1 0.0853 -0.2500 0.2205 10.50000 0.05 1.01 Q8 1 0.0630 0.2500 0.4155 10.50000 0.05 1.00 Q9 1 0.0714 0.2500 0.2309 10.50000 0.05 0.96 Q10 1 0.1599 -0.2500 0.3270 10.50000 0.05 0.95 Q11 1 0.1791 -0.0565 0.1507 11.00000 0.05 0.93 Q12 1 0.1965 0.2500 0.4085 10.50000 0.05 0.92 Q13 1 0.0938 0.1324 0.0821 11.00000 0.05 0.92 Q14 1 0.4607 0.2500 0.5237 10.50000 0.05 0.88 Q15 1 0.2184 0.2500 0.2292 10.50000 0.05 0.86 Q16 1 0.0059 0.2500 -0.1284 10.50000 0.05 0.86 Q17 1 0.1760 0.2500 0.1011 10.50000 0.05 0.85 Q18 1 0.0809 -0.2500 0.0968 10.50000 0.05 0.84 Q19 1 0.4560 0.2500 0.5560 10.50000 0.05 0.84 Q20 1 0.0452 0.1777 -0.2535 11.00000 0.05 0.84 [ Last edited by rain841230 on 2010-6-12 at 21:55 ] |
6樓2010-06-13 04:52:55
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wsht212(金幣+1):謝謝交流，希望常來 2010-06-13 23:30:03
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N4 1 0.147955 0.250000 -0.022404 10.50000 0.01842 0.01951 = 0.01010 0.00000 -0.00150 0.00000 AFIX 33 H4A 2 0.096861 0.330346 -0.019664 11.00000 -1.50000 H4B 2 0.122285 0.139716 -0.032566 11.00000 -1.50000 H4C 2 0.190521 0.279938 -0.067194 11.00000 -1.50000 AFIX 0 N4上面的氫加的不對(duì)，你母體原子的占有率才0.5，你加上的氫的占有率之和只能為1.5才對(duì)，你把你的晶體上傳到納米盤，我給你看看，你發(fā)消息給我。 |
7樓2010-06-13 08:12:53
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8樓2010-06-13 20:52:10
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wsht212(金幣+2):謝謝交流，希望常來！ 2010-06-14 08:56:29
rain841230(金幣+3):謝謝！ 2010-06-14 15:54:21
wsht212(金幣+2):謝謝交流，希望常來！ 2010-06-14 08:56:29
rain841230(金幣+3):謝謝！ 2010-06-14 15:54:21
| 你的晶體問題我看了，這個(gè)問題解決不了，我試了137,33都是你那樣的結(jié)果造成這個(gè)問題的原因是這樣的，在你的這個(gè)晶體中有一個(gè)對(duì)稱面，這個(gè)對(duì)稱面通過Ga4，N1，N4，這就是為什么這三個(gè)原子的占有率是0.5的原因。我們?cè)诩託涞臅r(shí)候一般都用理論加氫，這樣方便，這樣加氫，加氫的時(shí)候氫原子都是綁定在母體原子上，因此你給N1，和N4加氫的時(shí)候每個(gè)氫原子的占有率因該都為0.5，由于存在對(duì)稱面，而且這些氫原子不存在與對(duì)稱面上因此才會(huì)出現(xiàn)你說的問題，一般作圖的時(shí)候，我都是將對(duì)稱操作產(chǎn)生H的刪掉，這樣表面上看起來比較合理。還請(qǐng)高手指點(diǎn)！ |
9樓2010-06-14 08:34:33
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10樓2010-06-14 22:54:03
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