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xiaoyangyulv金蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】急!如何使用platon計(jì)算包含偏差的氫鍵 已有5人參與
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怎么樣用platon計(jì)算氫鍵呢?剛剛學(xué)了一下,可是得到了沒有偏差呀?應(yīng)該怎么獲得準(zhǔn)確的氫鍵偏差呢?還有platon可以計(jì)算pi-pi的距離,可是也沒有偏差呀?這個(gè)是我剛剛得到的數(shù)據(jù): (Nr Typ Res Donor --- H....Acceptor [ ARU ] D - H H...A D...A D - H...A A..H..A* A'..H..A" Sum\(XY,YZ\) Sum\(XZ\))s (------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------)s ( 1 1 O1 --H1WA ..O4 [ 2665.01] 0.80 1.96 2.7379 164)s ( 2 Intra 1 O1 --H1WB ..N5 [ ] 0.87 2.01 2.7610 145)s ( 3 1 N4 --H4 ..O5 [ 1565.01] 0.86 1.98 2.8386 177)s ( 4 1 N6 --H6 ..O4 [ 1545.01] 0.86 1.96 2.8233 176)s ( )s ( 5 1 C7 --H7 ..O2 [ 2666.01] 0.93 2.56 3.3077 137)s ( )s 謝謝幫忙。 |
金蟲 (小有名氣)
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我試了,還是沒有偏差呀,難道需要什么命令么?下面是我剛剛計(jì)算得到的,或者是我那里沒有操作明白呢? (Cg\(I\) Res\(I\) Cg\(J\) [ ARU\(J\)] Cg-Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S Alpha Beta Gamma CgI_Perp CgJ_Perp Slippage)s ( )s (Cg1 [ 1] -> Cg1 [ 2666.01] 5.2113 0.6484-0.1448-0.7474 -3.0743 0.00 48.71 48.71 3.439 3.439 3.915)s (Cg1 [ 1] -> Cg2 [ 2666.01] 4.4657 0.6481-0.1632-0.7438 -3.1546 1.07 39.27 39.26 3.458 3.457)s |
金蟲 (小有名氣)
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