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wjqhp木蟲 (正式寫手)
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[交流]
【已求助成功】如何從radial distribution function得到各層配位數(shù) 已有6人參與
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求助:想從RDF得到各層配位數(shù)。 困難:RDF圖從Forcite里面的radial distribution function已經(jīng) 得到。cluster模型為309個(gè)原子的icosahedron. 請(qǐng)教大家如何得到原子周圍的配位數(shù)?我不會(huì)分析這個(gè)RDF. 為什么只是得到一張圖和表格數(shù)據(jù),而沒有所謂的函數(shù)呢?似乎通過函數(shù)積分可以計(jì)算,但從圖和數(shù)據(jù)表出發(fā)也得不到函數(shù)。 期待大家?guī)椭,謝謝; 模型數(shù)據(jù)圖片和RDF數(shù)據(jù): http://cid-da311af543e0273b.office.live.com/browse.aspx/.Public [ Last edited by zzy870720z on 2010-7-1 at 08:15 ] |
我學(xué)習(xí)計(jì)算的一些帖子 | 徑向分布函數(shù) |

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木蟲 (正式寫手)

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木蟲 (正式寫手)
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感謝各位的討論,金幣持續(xù)發(fā)放中。 解決方案如下: 1. 重新認(rèn)識(shí)由Forcite analysis 得到的radial distribution function 本以為得到的RDF需要使用(N/V)*g(r)*4Pi*r^2*dr進(jìn)行積分,一直沒有得到正確結(jié)果。 實(shí)際上發(fā)現(xiàn)g(r)*4Pi*r^2*dr對(duì)(0,Rmax)積分結(jié)果為1. 這個(gè)定義在我看來,是MS的錯(cuò)誤,只要能解決問題就行,我也不議論這些了。 2. 利用N*g(r)*4Pi*r^2*dr對(duì).std數(shù)據(jù)表中所有數(shù)據(jù)加和,采用bin size=dr;就得到徑向分布各層的配位數(shù); 3. 殼層的定義 殼層的定義具有一定的主觀性,要根據(jù)自己的需要來定義“哪些相鄰的配位數(shù)是否屬于同一層“。 |

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